Contribution of rare coding mutations in CD36 to type 2 diabetes and cardio-metabolic complications
Notice bibliographique
Résumé
We sequenced coding regions of the cluster of differentiation 36 (CD36) gene in 184 French individuals of European ancestry presenting simultaneously with type 2 diabetes (T2D), arterial hypertension, dyslipidemia, and coronary heart disease. We identified rare missense mutations (p.Pro191Leu/rs143150225 and p.Ala252Val/rs147624636) in two heterozygous cases. The two CD36 mutation carriers had no family history of T2D and no clustering of cardio-metabolic complications. While the p.Pro191Leu mutation was found in 84 heterozygous carriers from five ethnic groups from the genome aggregation database (global frequency: 0.0297%, N = 141,321), only one European carrier of the p.Ala252Val mutation was identified (global frequency: 0.00040%, N = 125,523). The Pro191 and Ala252 amino acids were not conserved (74.8% and 68.9% across 131 animal species, respectively). In vitro experiments showed that the two CD36 mutant proteins are expressed and trafficked to the plasma membrane where they bind modified low-density-lipoprotein (LDL) cholesterol as normal. However, molecular modelling of the recent CD36 crystal structure showed that Pro191 was located at the exit/entrance gate of the lipid binding chamber and Ala252 was in line with the chamber. Overall, our data do not support a major contribution of CD36 rare coding mutations to T2D and its cardio-metabolic complications in the French population.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».