Characterization of X-ray diffraction intensity function from a biological molecule for single particle imaging
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Notice bibliographique
Résumé
An attainable structural resolution of single particle imaging is determined by the characteristics of X-ray diffraction intensity, which depend on the incident X-ray intensity density and molecule size. To estimate the attainable structural resolution even for molecules whose coordinates are unknown, this research aimed to clarify how these characteristics of X-ray diffraction intensity are determined from the structure of a molecule. The functional characteristics of X-ray diffraction intensity of a single biomolecule were theoretically and computationally evaluated. The wavenumber dependence of the average diffraction intensity on a sphere of constant wavenumber was observable by small-angle X-ray solution scattering. An excellent approximation was obtained, in which this quantity was expressed by an integral transform of the product of the external molecular shape and a universal function related to its atom packing. A standard model protein was defined by an analytical form of the first factor characterized by molecular volume and length. It estimated the numerically determined wavenumber dependence with a worst-case error of approximately a factor of five. The distribution of the diffraction intensity on a sphere of constant wavenumber was also examined. Finally, the correlation of diffraction intensities in the wavenumber space was assessed. This analysis enabled the estimation of an attainable structural resolution as a function of the incident X-ray intensity density and the volume and length of a target molecule, even in the absence of molecular coordinates.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle