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Enregistrement W2990592270 · doi:10.1016/j.gore.2019.100521

Targeted sequencing of histologically defined serous endometrial cancer reflects prognosis and correlates with preoperative biopsy

2019· article· en· W2990592270 sur OpenAlexaff
Jeremie Abitbol, Zainab Amajoud, Ido Laskov, Alex Ferenczy, Manuela Pelmus, Neta Eisenberg, Roy Kessous, Emad Matanes, Susie Lau, Amber Yasmeen, Vanessa M. López‐Ozuna, Shannon Salvador, Walter H. Gotlieb

Notice bibliographique

RevueGynecologic Oncology Reports · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics
Établissements canadiensMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesAmerican Physicians Fellowship for Medicine in IsraelCancer Research Foundation
Mots-clésMedicineSerous fluidEndometrial cancerBiopsyOncologyCancerInternal medicinePathologyRadiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The aim of this study was to evaluate the impact of discordant endometrial sampling on the prognosis of patients finally diagnosed with uterine papillary serous carcinoma (UPSC) and to analyze UPSC mutational profile. Retrospective cohort study comparing outcomes of patients post-operatively diagnosed with UPSC and preoperatively diagnosed with endometrioid endometrial cancer (EEC) or UPSC. Genes commonly implicated in carcinogenesis were analyzed in a subgroup of 40 patients post-operatively diagnosed with UPSC, using next generation sequencing. 61 patients with UPSC on post-surgical, final pathology were included in the study. Prior to surgery, 15 were diagnosed with EEC (discordant) and 46 were correctly diagnosed with UPSC (concordant). After a median follow-up of 41.6 months [5.4-106.7], a preoperative diagnosis of EEC was associated with better 3-year progression-free survival (100% vs. 60.9%, P = 0.003) and longer disease free interval (63.5 versus 15 months, P = 0.026) compared to patients with an initial diagnosis of UPSC. Patients with a concordant diagnosis of UPSC were 5 times more likely to progress or die compared to those with a discordant EEC diagnosis (P = 0.02, P = 0.03, respectively), and their tumors were associated with higher rates of TP53 (88.9% vs. 61.5%, P = 0.04), and a lower rate of PTEN (14.8% vs. 38.5%, P = 0.09) and ARID1A (3.7% vs. 23.1%, P = 0.05) mutations. A pre-surgical diagnosis of EEC is associated with improved prognosis in patients with UPSC. Some histologically defined UPSC tumors contain endometrioid-like molecular characteristics that may confer a survival advantage, suggesting a possible need for molecular approaches to better stratify patients into risk groups.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,199
Score d'incertitude au seuil0,705

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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