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Enregistrement W2990731868 · doi:10.1183/13993003.congress-2019.pa4988

Development of a quality assessment algorithm for multiple breath nitrogen washout

2019· article· en· W2990731868 sur OpenAlexaff
Renée Jensen, Reginald McDonald, Michelle Klingel, Sanja Stanojevic, Félix Ratjen

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCystic Fibrosis Research Advances
Établissements canadiensHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineAlgorithmStatisticsData miningMathematicsComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: There is a need to integrate quality control (QC) into multiple breath washout (MBW) tests to facilitate accurate interpretation of results. We aimed to develop an algorithm to automate application of QC criteria for MBW. Methods: We defined quantitative measures of quality into a series of algorithms [Jensen R. et al. PLoS ONE; 2016] and applied these to MBW data collected on the Exhalyzer® D (EcoMedics AG). The performance of the algorithm was compared to independent assessment by experienced reviewers. Results: Anonymized MBW data (15,070 trials; 2,866 tests) in healthy children, and subjects with Cystic Fibrosis, were retrospectively evaluated using the algorithm. Seventy percent of trials were categorized as accept/exclude, whereas 30% were flagged for manual review. The algorithm agreed with the reviewer’s decision for 88% of trials. The lung clearance index was similar between the algorithm and reviewers (Δ -0.01, limits of agreement -0.31, 0.29) and resulted in a similar proportion of acceptable test occasions (86.4% vs. 83.6%). An equal number of trials flagged for review were subsequently classified as accept/exclude by reviewers. Conclusion: QC criteria can successfully be applied to MBW data using an algorithm and only requires review in approximately 30% of trials. The agreement between the algorithm and manual review was similar to previously observed inter-reviewer agreement [Jensen R. et al. PLoS ONE; 2016]; disagreement may reflect subjective interpretation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,099
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,248
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,099
Score d'incertitude au seuil0,524

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0990,248
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,003
Bibliométrie0,0130,006
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0070,003
Science ouverte0,0040,003
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,398
Écart entre enseignants0,350 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
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Résumé présentoui

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