Using morphological measurements to predict subspecies of Midcontinent sandhill cranes
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT The Midcontinent population of sandhill cranes ( Antigone canadensis ) has historically been classified into 3 putative subspecies, but genetic analyses have identified only 2 genetically distinct subspecies. Previous studies have successfully used morphometrics in combination with an individual's sex to differentiate subspecies of sandhill cranes that had been inferred based on breeding area, but no study has used a sample of genetically determined subspecies to discriminate and develop predictive models. Using measurements from 843 adult sandhill cranes captured throughout their range and annual cycle (in 4 States and 1 Canadian province during 1998–2007), we used linear discriminant analysis to classify genetically identified A. c. canadensis (lesser) and A. c. tabida (greater) sandhill crane subspecies, and developed a field‐ready tool to predict subspecies using common morphometric measurements without determination of an individual's sex. Our top‐ranked model was 89.5% accurate overall, and used flattened wing chord, total culmen, and tarsometatarsus lengths to correctly identify 93.1% of A. c. canadensis and 82.8% of A. c. tabida subspecies. Additionally, we identified measurement thresholds based on posterior probabilities of correct classification to aid in subspecies determination when the linear discriminant procedure provided equivocal results. We also investigated whether sex determination could increase accuracy of our top‐ranked model, and found that accuracy increased <1% when including this information. We suggest collection of the morphometric measurements used in our top‐ranked model to determine subspecies of adult Midcontinent sandhill cranes. Our method does not require determining sex of the individual to correctly classify subspecies, allows for accurate and rapid subspecies determination, and can largely avoid additional costs and time associated with genetic analyses to determine subspecies. © 2019 The Wildlife Society.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».