An mRNA-binding channel in the ES6S region of the translation 48S-PIC promotes RNA unwinding and scanning
Notice bibliographique
Résumé
Loading of mRNA onto the ribosomal 43S pre-initiation complex (PIC) and its subsequent scanning require the removal of the secondary structure of the by RNA helicases such as eIF4A. However, the topology and mechanics of the scanning complex bound to mRNA (48S-PIC) and the influence of its solvent-side composition on the scanning process are poorly known. Here, we found that the ES6S region of the 48S-PIC constitutes an extended binding channel for eIF4A-mediated unwinding of mRNA and scanning. Blocking ES6S inhibited the cap-dependent translation of mRNAs that have structured 5' UTRs (including G-quadruplexes), many of which are involved in signal transduction and growth, but it did not affect IRES-driven translation. Genome-wide analysis of mRNA translation revealed a great diversity in ES6S-mediated scanning dependency. Our data suggest that mRNA threading into the ES6S region makes scanning by 48S PIC slower but more processive. Hence, we propose a topological and functional model of the scanning 48S-PIC.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».