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Enregistrement W2991318718 · doi:10.1016/j.heliyon.2019.e02938

Abcam Monoclonal Egr-1 ab133695 is an effective primary antibody replacement for Santa Cruz sc-189 polyclonal Egr-1 in songbirds

2019· article· en· W2991318718 sur OpenAlexafffund
Erin N. Scully, Juliana Montoya Sanchez, Christopher B. Sturdy

Notice bibliographique

RevueHeliyon · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAnimal Vocal Communication and Behavior
Établissements canadiensWomen and Children’s Health Research InstituteUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésPolyclonal antibodiesSongbirdMonoclonal antibodyBiologyNeuroscienceAntibodyImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The immediate early gene ZENK (acronym zif268, Egr-1, NGFI-A, krox24) has been used extensively in songbird research (Mello et al., 1992; Jarvis and Nottebohm, 1997), as well as other research areas. ZENK has been used in assessing learning and memory, measuring neural activation, and identifying the cellular and molecular substrates involved in the first stages of memory formation (Watson and Clements, 1980). Previous songbird research has found that neurons located within the areas involved in auditory perception, namely the caudomedial nidopallium and caudomedial mesopallium, exhibit high levels of ZENK protein expression in response to conspecific songs and calls (Mello and Ribeiro, 1998; Avey et al., 2011). NEW METHOD: In large part due to its neuronal-specific labeling of ZENK protein, Santa Cruz Egr-1 sc-189 has been widely accepted as the standard primary antibody in songbird research. However, Santa Cruz Biotechnology Egr-1 no longer specifically labels and has also discontinued production of Egr-1 sc-189. Thus, the current study is focused on analyzing the effectiveness of alternative primary antibodies: Abcam polyclonal c-Fos, Abcam monoclonal ab133695 Egr-1, and Proteintech polyclonal Egr-1. RESULTS: Abcam monoclonal Egr-1 was successful in specifically labeling ZENK positive cells in the songbird auditory nuclei. Abcam polyclonal c-Fos and Proteintech polyclonal Egr-1 were found to have non-specific labeling. COMPARISON WITH EXISTING METHODS: Abcam monoclonal Egr-1 ab133695 was found to produce differential and specific labeling in the targeted auditory nuclei similar to previous studies successfully using Santa Cruz polyclonal Egr-1 (i.e. Mello and Ribeiro, 1998). CONCLUSIONS: Abcam monoclonal Egr-1 effectively labels ZENK in the songbird auditory nuclei, making it a suitable primary antibody replacement for Santa Cruz polyclonal Egr-1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,599
Score d'incertitude au seuil0,885

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,327
Écart entre enseignants0,310 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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