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Enregistrement W2991340168 · doi:10.17504/protocols.io.i9zch76

Promoter methylation of eight tumor-suppressor genes and the risk of thyroid cancer: A meta-analysis protocol v1

2017· preprint· en· W2991340168 sur OpenAlexaboutno aff
Fatemeh Khatami, Seyed Mohammad Tavangar

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueThyroid Cancer Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésThyroid cancerPublication biasMeta-analysisOdds ratioDNA methylationMedicineOncologySystematic reviewCancerInternal medicineObservational studyMEDLINEBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction The incidence of thyroid cancer is increasing and histological test by itself cannot differentiate thyroid cancer from some benign nodules. Our immediate goal is to meta-analysis and determines the impact of promoter methylation of eight selected candidate TSGs on thyroid cancer and to identify the most important molecules in this carcinogenesis pathway. Methods and analysis We will include observational studies evaluating the promoter methylation in patients with thyroid cancer. A comprehensive search was performed using PubMed, Scopus, and ISI Web of Knowledge databases, and eligible studies were included. The methodological quality of the included studies was evaluated according to the Newcastle Ottawa scale table and pooled odds ratios (ORs); 95% confidence intervals (CIs) were used to estimate the strength of the associations with Stata 12.0 software. Egger’s and Begg’s tests were applied to detect publication bias, in addition to the “metatrim” method. Ethics and dissemination No ethical issues are predicted. These findings will be published in a peer-reviewed journal and presented at national and international conferences. Registration number This systematic review protocol is registered in the PROSPERO International Prospective Register of Systematic Reviews, registration number (CRD42016033484). Strengths and limitations of this study This systematic review, for the first time, will conduct to evaluate the prognostic and diagnostic accuracy of DNA methylation in patients with thyroid cancer using comprehensive search of several databases. The study screening, data extraction, and risk of bias assessment of the current study will be conducted by two researchers independently. We expect some potential heterogeneities between previous studies, including stage, and histological grade in patient samples.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,039
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,081
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: Protocole
Score de désaccord entre enseignants0,053
Score d'incertitude au seuil0,207

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0390,081
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0040,003
Méta-épidémiologie (sens large)0,0150,028
Bibliométrie0,0060,007
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0040,003
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0050,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0530,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,058
Tête enseignante GPT0,354
Écart entre enseignants0,296 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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