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Enregistrement W2991396635 · doi:10.1101/857839

The genomic landscape of intrinsic and acquired resistance to cyclin-dependent kinase 4/6 inhibitors in patients with hormone receptor positive metastatic breast cancer

2019· preprint· en· W2991396635 sur OpenAlexaff
Seth A. Wander, Ofir Cohen, Xueqian Gong, Gabriela N. Johnson, Jorge E. Buendia-Buendia, Maxwell R. Lloyd, Dewey Kim, Flora Luo, Pingping Mao, Karla Helvie, Kailey J. Kowalski, Utthara Nayar, Adrienne G. Waks, Stephen H. Parsons, Ricardo Martínez, Lacey M. Litchfield, Xiang S. Ye, Chun Ping Yu, Valerie M. Jansen, John R. Stille, Patricia S. Smith, Gerard J. Oakley, Quincy S. Chu, Gerald Batist, Melissa E. Hughes, Jill D. Kremer, Levi A. Garraway, Eric P. Winer, Sara M. Tolaney, Nancy U. Lin, Sean G. Buchanan, Nikhil Wagle

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdvanced Breast Cancer Therapies
Établissements canadiensMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesGenentechEisaiDaiichi-SankyoFoundation MedicineMacroGenicsPuma BiotechnologySanofiExelixisArray BioPharmaCelldex TherapeuticsAmgenPfizerCelgeneAstraZenecaEli Lilly and CompanyBristol-Myers Squibb
Mots-clésCancer researchKRASAKT1KinaseBreast cancerCyclin-dependent kinase 4CancerMAPK/ERK pathwayCHEK1Protein kinase BBiologyMedicineInternal medicineCell cycleCell cycle checkpointSignal transductionGeneticsCyclin-dependent kinase 2

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Clinical resistance mechanisms to CDK4/6 inhibitors in HR+ breast cancer have not been clearly defined. Whole exome sequencing of 59 tumors with CDK4/6i exposure revealed multiple candidate resistance mechanisms including RB1 loss, activating alterations in AKT1 , RAS , AURKA , CCNE2, ERBB2, and FGFR2, and loss of ER expression. In vitro experiments confirmed that these alterations conferred CDK4/6i resistance. Cancer cells cultured to resistance with CDK4/6i also acquired RB1 , KRAS , AURKA , or CCNE2 alterations, which conferred sensitivity to AURKA, ERK, or CHEK1 inhibition. Besides inactivation of RB1, which accounts for ∼5% of resistance, seven of these mechanisms have not been previously identified as clinical mediators of resistance to CDK4/6 inhibitors in patients. Three of these—RAS activation, AKT activation, and AURKA activation—have not to our knowledge been previously demonstrated preclinically. Together, these eight mechanisms were present in 80% of resistant tumors profiled and may define therapeutic opportunities in patients. Significance We identified eight distinct mechanisms of resistance to CDK4/6 inhibitors present in 80% of resistant tumors profiled. Most of these have a therapeutic strategy to overcome or prevent resistance in these tumors. Taken together, these findings have critical implications related to the potential utility of precision-based approaches to overcome resistance in many patients with HR+ MBC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,365
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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