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Enregistrement W2991802127 · doi:10.1172/jci130206

DGCR8 microprocessor defect characterizes familial multinodular goiter with schwannomatosis

2019· article· en· W2991802127 sur OpenAlexafffundabout
Bárbara Rivera, Javad Nadaf, Somayyeh Fahiminiya, María Apellániz-Ruiz, Avi Saskin, Anne‐Sophie Chong, Sahil Sharma, Rabea Wagener, Timothée Revil, Vincenzo Condello, Zineb Harra, Nancy Hamel, Nelly Sabbaghian, Karl Muchantef, Christian Thomas, Leanne de Kock, Marie‐Noëlle Hébert‐Blouin, Angelia V. Bassenden, Hannah Rabenstein, Özgür Mete, Ralf Paschke, Marc Pusztaszeri, Werner Paulus, Albert M. Berghuis, Jiannis Ragoussis, Yuri E. Nikiforov, Reiner Siebert, Steffen Albrecht, Robert Turcotte, Martin Hasselblatt, Marc R. Fabian, William D. Foulkes

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Investigation · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueThyroid Cancer Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity Health NetworkMcGill University Health CentreUniversity of CalgaryMcGill UniversityMontreal Children's HospitalMcGill University and Génome Québec Innovation CentreJewish General Hospital
Organismes subventionnairesJewish General HospitalCompute CanadaBanca d'ItaliaMcGill UniversityCanadian Institutes of Health ResearchAlex's Lemonade Stand Foundation for Childhood Cancer
Mots-clésLoss of heterozygosityBiologymicroRNAPathologyGeneticsCancer researchMedicineAlleleGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUNDDICER1 is the only miRNA biogenesis component associated with an inherited tumor syndrome, featuring multinodular goiter (MNG) and rare pediatric-onset lesions. Other susceptibility genes for familial forms of MNG likely exist.METHODSWhole-exome sequencing of a kindred with early-onset MNG and schwannomatosis was followed by investigation of germline pathogenic variants that fully segregated with the disease. Genome-wide analyses were performed on 13 tissue samples from familial and nonfamilial DGCR8-E518K-positive tumors, including MNG, schwannomas, papillary thyroid cancers (PTCs), and Wilms tumors. miRNA profiles of 4 tissue types were compared, and sequencing of miRNA, pre-miRNA, and mRNA was performed in a subset of 9 schwannomas, 4 of which harbor DGCR8-E518K.RESULTSWe identified c.1552G>A;p.E518K in DGCR8, a microprocessor component located in 22q, in the kindred. The variant identified is a somatic hotspot in Wilms tumors and has been identified in 2 PTCs. Copy number loss of chromosome 22q, leading to loss of heterozygosity at the DGCR8 locus, was found in all 13 samples harboring c.1552G>A;p.E518K. miRNA profiling of PTCs, MNG, schwannomas, and Wilms tumors revealed a common profile among E518K hemizygous tumors. In vitro cleavage demonstrated improper processing of pre-miRNA by DGCR8-E518K. MicroRNA and RNA profiling show that this variant disrupts precursor microRNA production, impacting populations of canonical microRNAs and mirtrons.CONCLUSIONWe identified DGCR8 as the cause of an unreported autosomal dominant mendelian tumor susceptibility syndrome: familial multinodular goiter with schwannomatosis.FUNDINGCanadian Institutes of Health Research, Compute Canada, Alex's Lemonade Stand Foundation, the Mia Neri Foundation for Childhood Cancer, Cassa di Sovvenzioni e Risparmio fra il Personale della Banca d'Italia, and the KinderKrebsInitiative Buchholz/Holm-Seppensen.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,383

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,334
Écart entre enseignants0,299 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations62
Publié2019
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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