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Enregistrement W2991900109 · doi:10.22215/etd/2019-13714

Reversible Enzyme Phosphorylation as a Mechanism for Metabolic Adaptation to Dehydration in the Skeletal Muscle of the African Clawed Frog, Xenopus laevis

2019· dissertation· en· W2991900109 sur OpenAlexaff
Christie Childers

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolism, Diabetes, and Cancer
Établissements canadiensCarleton UniversitySt. Francis Xavier University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSkeletal muscleBiologyPyruvate kinaseGlycolysisHexokinaseBiochemistryPhosphocreatineDehydrationXenopusGlycogenAldolase AInternal medicineEndocrinologyEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Xenopus laevis, although mainly an aquatic frog, lives in seasonally arid regions of southern Africa where well-developed dehydration tolerance is needed when ponds dry up.Frogs can endure about 40% loss of total body water leading to increased hematocrit and blood viscosity that restrict blood and oxygen delivery to tissues, elevate tissue osmolality, and lead to accumulation of lactate and urea.As one response to dehydration, frogs show restricted blood flow to skeletal muscle to preferentially maintain supply to the brain and internal organs.I hypothesized that dehydration stress triggers modifications to cellular energy production in skeletal muscle and could recruit alternative fuel use.This thesis explores metabolic regulation of enzymes (aldolase, CK, IDH), and energy stress signaling (via AMPK) in skeletal muscle of X. laevis.A particular focus was put on regulation via protein posttranslational phosphorylation to adapt enzyme activity and substrate affinity to changing physiological needs during dehydration.Analysis of kinetic parameters found that aldolase, CK and IDH all showed reduced maximal velocities and altered substrate affinities during dehydration.Downregulation of aldolase suggested a reduction in glycolytic rate during dehydration, moderating the use of glucose, whereas CK regulation modulates phosphocreatine consumption.Substrate affinities of both CK and IDH were dependent on magnesium concentrations.CK was more active at higher Mg 2+ concentrations that occur as tissues dehydrate whereas IDH showed increased affinity for Mg 2+ that could shift the reaction to favor α-KG production during dehydration.I hypothesized that changes to muscle energetics would stimulate the action of AMPK and its downstream effectors to promote a fuel switching from carbohydrates to include fats during dehydration.However, iv phosphorylated AMPK (activated) did not increase and the regulation of two key downstream AMPK targets, acetyl-coA carboxylase and Unc-51 like autophagy activating kinase 1, did not indicate recruitment of fatty acid metabolism or autophagy for energy during dehydration in skeletal muscle.Overall, these studies showed that reversible protein phosphorylation has a prominent role in controlling X. laevis skeletal muscle enzyme function and reorganization of metabolic pathways during whole animal dehydration.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
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