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Enregistrement W2992067460 · doi:10.1101/19007781

Acquisition of extended-spectrum beta-lactamase-producing Enterobacteriaceae (ESBL-PE) carriage after exposure to systemic antimicrobials during travel: systematic review and meta-analysis

2019· preprint· en· W2992067460 sur OpenAlexaff
Terence Wuerz, Sameer S. Kassim, Katherine E. Atkins

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensUniversity of ManitobaSt. Boniface Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAntimicrobialCarriageOdds ratioMedicineContext (archaeology)Antibiotic resistanceAntimicrobial stewardshipMeta-analysisInternal medicineAntibioticsMicrobiologyBiologyPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Background International travel is an important risk factor for colonization with extended-spectrum beta-lactamase-producing Enterobacteriaceae (ESBL-PE). Antimicrobial use during travel likely amplifies this risk, yet to what extent, and whether it varies by antimicrobial class, has not been established. Methods We conducted a systematic review that included prospective cohorts reporting both receipt of systemic antimicrobials and acquired ESBL-PE isolated from stool or rectum during international travel. We performed a random effects meta-analysis to estimate odds of acquiring ESBL-PE due to antimicrobials during travel, overall and by antimicrobial class. Results Fifteen studies were included. The study population was mainly female travellers from high income countries recruited primarily from travel clinics. Participants travelled most frequently to Asia and Africa with 10% reporting antimicrobial use during travel. The combined odds ratio (OR) for ESBL-PE acquisition during travel was 2.37 for antimicrobial use overall (95% confidence interval [CI], 1.69 to 3.33), but there was substantial heterogeneity between studies. Fluoroquinolones were the antibiotic class associated with the highest combined OR of ESBL-PE acquisition, compared to no antimicrobial use (OR 4.68, 95% CI, 2.34 to 9.37). Conclusions The risk of ESBL-PE colonization during travel is increased substantially with exposure to antimicrobials, especially fluoroquinolones. While a small proportion of colonized individuals will develop a resistant infection, there remains the potential for onward spread among returning travellers. Public health efforts to decrease inappropriate antimicrobial usage during travel are warranted. Research in context Evidence before this study Antimicrobial resistance (AMR) among bacteria that commonly cause human infection is of increasing public health concern. International travel has recently been associated with colonization with Extended-Spectrum Beta-Lactamase Producing-Enterobacteriaceae (ESBL-PE), increasing the spread of drug resistance among these important pathogens. We searched Pubmed, Embase, MEDLINE, Web of Science, SCOPUS, and the Cochrane Library for prospective cohort studies published between January 2000 and June 2018, reporting on acquisition of ESBL-PE among travellers, which reported on antimicrobial use during travel. 15 studies were included, which were at moderate risk of bias. The pooled odds ratio for acquisition of ESBL-PE during travel was 2.37 among antimicrobial users, compared to non-users (95% CI, 1.69 to 3.33). The magnitude of this association was stronger among travellers reporting fluoroquinolone use (OR 4.68, 95% CI 2.34 to 9.37). Added value of this study This is the first study to quantify the association between antimicrobial use during travel, overall and by specific antimicrobial class, with ESBL-PE acquisition across broad populations of travellers and destination countries. Implications of all the available evidence Further study into the mechanisms by which antimicrobials, such as fluoroquinolones, contribute to AMR may identify protective measures. Meanwhile, antimicrobial use during travel for prevention or treatment of mild-to-moderate traveller’s diarrhea should not be recommended routinely. Where indicated, alternatives to fluoroquinolone antimicrobials should be considered.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,010
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,029
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: Méta-analyse
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,051

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0100,029
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0170,035
Bibliométrie0,0070,008
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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