Identifying genes associated with biofilm production in Pseudomonas aeruginosa
Notice bibliographique
Résumé
Pseudomonas aeruginosa is an opportunistic pathogen associated with a variety of life-threatening diseases. Infections caused by P. aeruginosa can be nearly untreatable because of its multidrug-resistance. One of the characteristics of P. aeruginosa that helps it survive in high drug concentrations is its ability to form biofilms–large communities of cells encompassed by extracellular polymeric substances that defend against many antibiotics. In fact, sub-minimum inhibitory concentrations of antibiotics stimulate biofilm production. This project aims to identify genes associated with biofilm induction in P. aeruginosa by screening a transposon mutant library for mutants that fail to show increased biofilm production when exposed to sub-minimum inhibitory concentrations of cefixime, tobramycin, and thiostrepton. So far, we have identified one gene, PA2714, that encodes a predicted molybdopterin oxidoreductase required for biofilm production. Because of the strong association between biofilm production and antibiotic tolerance in P. aeruginosa, the gene identified in this screen may be a useful therapeutic target for novel antimicrobialsthat can disrupt biofilm formation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».