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Enregistrement W2992758268 · doi:10.1002/bdr2.1628

Refinement of inducible gene deletion in embryos of pregnant mice

2019· article· en· W2992758268 sur OpenAlexfundno aff
Dawn Savery, Eirini Maniou, Lucy H. Culshaw, Nicholas D. E. Greene, Andrew J. Copp, Gabriel L. Galea

Notice bibliographique

RevueBirth Defects Research · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePluripotent Stem Cells Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilNational Centre for the Replacement Refinement and Reduction of Animals in ResearchNational Centre for the Replacement, Refinement and Reduction of Animals in ResearchMedical Research Council CanadaWellcome Trust
Mots-clésEmbryonic stem cellEmbryoTamoxifenSOX2BiologyNeuroepithelial cellEx vivoGeneAndrologyCell biologyChemistryMolecular biologyIn vivoGeneticsMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract CreERT2‐mediated gene recombination is widely applied in developmental biology research. Activation of CreERT2 is typically achieved by injection of tamoxifen in an oily vehicle into the peritoneal cavity of mid‐gestation pregnant mice. This can be technically challenging and adversely impacts welfare. Here we characterize three refinements to this technique: Pipette feeding (not gavage) of tamoxifen, ex vivo CreERT2 activation in whole embryo culture and injection of cell‐permeable TAT‐Cre into Cre‐negative cultured embryos. We demonstrate that pipette feeding of tamoxifen solution to the mother on various days of gestation reliably activates embryonic CreERT2, illustrated here using β‐Actin CreERT2, Sox2 CreERT2, T CreERT2, and Nkx1.2 CreERT2. Pipette feeding of tamoxifen induces dose‐dependent recombination of Rosa26 mTmG reporters when administered at E8.5. Activation of two neuromesodermal progenitor‐targeting Cre drivers, T CreERT2, and Nkx1.2 CreERT2, produces comparable neuroepithelial lineage tracing. Dose‐dependent CreERT2 activation can also be achieved by brief exposure to 4OH‐tamoxifen in whole embryo culture, allowing temporal control of gene deletion and eliminating the need to treat pregnant mice. Rosa26 mTmG reporter recombination can also be achieved regionally by injecting TAT‐Cre into embryonic tissues at the start of culture. This allows greater spatial control over Cre activation than can typically be achieved with endogenous CreERT2, for example by injecting TAT‐Cre on one side of the midline. We hope that our description and application of these techniques will stimulate refinement of experimental methods involving CreERT2 activation for gene deletion and lineage tracing studies. Improved temporal (ex vivo treatment) and spatial (TAT‐Cre injection) control of recombination will also allow previously intractable questions to be addressed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,327
Écart entre enseignants0,291 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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