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Enregistrement W2992929603 · doi:10.1182/bloodadvances.2019000989

Molecular features of a large cohort of primary central nervous system lymphoma using tissue microarray

2019· article· en· W2992929603 sur OpenAlexafffund
Diego Villa, King Tan, Christian Steidl, Susana Ben‐Neriah, Muntadhar Al Moosawi, Tamara Shenkier, Joseph M. Connors, Laurie H. Sehn, Kerry J. Savage, David W. Scott, Randy D. Gascoyne, Graham W. Slack

Notice bibliographique

RevueBlood Advances · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLymphoma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensSpinal Cord Injury BCUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBCL6Tissue microarrayPrimary central nervous system lymphomaLymphomaImmunohistochemistryDiffuse large B-cell lymphomaGerminal centerPathologyPopulationBiologyCancer researchMedicineOncologyB cellImmunologyAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The objective of this study was to evaluate the distribution and prognostic impact of a broad range of molecular attributes in a large cohort of immunocompetent patients with primary central nervous system lymphoma (PCNSL) by using tissue microarray. Patients diagnosed with PCNSL were initially identified in the BC Cancer Lymphoid Cancer clinical and pathology databases. Tissue microarrays were constructed by using archival formalin-fixed paraffin-embedded diagnostic biopsy tissue. Immunohistochemistry and fluorescent in situ hybridization studies were performed. A total of 115 patients with PCNSL with diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) histology were identified. The majority of cases (≥75%) had a non-germinal center B-cell phenotype according to immunohistochemistry algorithms, but cell of origin did not affect progression-free or overall survival. MYC (40%), BCL2 (75%), and programmed death-ligand 1 (29%) protein expression were common, but their corresponding gene rearrangements were rare (≤1% each), suggesting that alternate mechanisms were driving expression. There were no dual rearrangements involving MYC and BCL2. Only 22% of cases had membranous expression of major histocompatibility complex class II, suggesting a mechanism for escape from immune surveillance. Epstein-Barr virus-encoded RNA was positive in 1 immunocompetent patient. BCL6 protein expression (77%) and BCL6 rearrangements (31%) were frequent; the latter was the only factor associated with a poor prognosis in the overall cohort and in the subgroup of 52 patients treated with high-dose methotrexate-based regimens. This large population-based study shows that prominent molecular features of PCNSL are unique and different from those of systemic DLBCL. These results may better inform drug development in PCNSL.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,246
Score d'incertitude au seuil0,540

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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