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Enregistrement W2993044950 · doi:10.1097/wco.0000000000000786

RNA expression studies in stroke: what can they tell us about stroke mechanism?

2019· review· en· W2993044950 sur OpenAlexafffund
Sarina Falcione, Joseph Kamtchum‐Tatuene, Gina Sykes, Glen C. Jickling

Notice bibliographique

RevueCurrent Opinion in Neurology · 2019
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCerebrovascular and genetic disorders
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésStroke (engine)MedicineBiomarkerMechanism (biology)microRNABioinformaticsGeneBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE OF REVIEW: Diagnosis of stroke and understanding the mechanism of stroke is critical to implement optimal treatment. RNA expressed in peripheral blood cells is emerging as a precision biomarker to aid in stroke diagnosis and prediction of stroke cause. In this review, we summarize available data regarding the role of RNA to predict stroke, the rationale for these changes, and a discussion of novel mechanistic insight and clinical applications. RECENT FINDINGS: Differences in RNA gene expression in blood have been identified in patients with stroke, including differences to distinguish ischemic from hemorrhagic stroke, and differences between cardioembolic, large vessel atherosclerotic, and small vessel lacunar stroke cause. Gene expression differences show promise as novel stroke biomarkers to predict stroke of unclear cause (cryptogenic stroke). The differences in RNA expression provide novel insight to stroke mechanism, including the role of immune response and thrombosis in human stroke. Important insight to regulation of gene expression in stroke and its causes are being acquired, including alternative splicing, noncoding RNA, and microRNA. SUMMARY: Improved diagnosis of stroke and determination of stroke cause will improve stroke treatment and prevention. RNA biomarkers show promise to aid in the diagnosis of stroke and cause determination, as well as providing novel insight to mechanism of stroke in patients. While further study is required, an RNA profile may one day be part of the stroke armamentarium with utility to guide acute stroke therapy and prevention strategies and refine stroke phenotype.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,003
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,141
Tête enseignante GPT0,417
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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