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Enregistrement W2993609181 · doi:10.1093/jas/skz258.572

PSVIII-12 Comparative characterization of intestinal alkaline phosphatase kinetics in young piglets and human Caco-2 cells

2019· article· en· W2993609181 sur OpenAlexaff
N. Burello, Hua Zhang, Weijun Wang, Tania Archbold, Rong Tsao, Ming Fan

Notice bibliographique

RevueJournal of Animal Science · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlkaline Phosphatase Research Studies
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAlkaline phosphataseDephosphorylationContext (archaeology)PhosphataseMolecular biologyChemistryGeneCaco-2EnzymePhosphoric monoester hydrolasesBiologyBiochemistryIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract This study reports the kinetics of young porcine jejunal alkaline phosphatase (IAP) towards the dephosphorylation of ATP, lipopolysaccharides (LPS) and p-nitrophenyl phosphate (pNPP) at the physiological conditions (pH = 7.4; and at 37 °C) in comparison with the IAP from human Caco-2 cells. The 10-day suckling young porcine jejunal IAP displayed the Km values of 1.26±0.50 mM, 1.35±0.64 mg/mL and 0.290±0.072 mM for the hydrolyses of ATP, LPS and pNPP, respectively; while the respective Km values were 0.030±0.007 mM, 0.66±0.22 mg/mL and 0.033±0.006 mM for the IAP in the Caco-2 cells towards the same set of substrates. In comparison, the Km values of the young porcine jejunal IAP were 2–40 times higher than those of IAP from the human Caco-2 cells. In addition, Pearson correlation analyses showed tight positive correlations (P < 0.001) between IAP activities towards pNPP, ATP and LPS in the piglet and the Caco-2 cells, suggesting that the IAP activity towards pNPP could be used to predict the IAP activities on the physiological substrates of ATP and LPS. Lastly, four AP genes were identified in the genome of Sus scrofa. Three of these porcine AP genes are annotated as intestinal-type alkaline phosphatase (IAP) genes and clustered at the distal end of chromosome 15, namely IAPX1, IAPX2, and IAPX3. The genomic context of APs in the pig genome is highly similar to those in the human genome. We predict that pig IAPX3 (XP_003133777.1) is likely an IAP gene for pigs. Further comparisons in post-translational modification and protein 3-D structure modelling were performed, indicating that the observed differences in kinetic affinity between the young porcine jejunal IAP and the human Caco-2 cell IAP in hydrolyzing ATP, LPS and pNPP might relate to their differences in the coding sequences of the IAP protein, and/or the IAP protein N-glycosylation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,510
Score d'incertitude au seuil0,345

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,349
Écart entre enseignants0,313 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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