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Enregistrement W2993699535 · doi:10.1021/acs.bioconjchem.9b00710

Fluorogen-Activating Proteins: Next-Generation Fluorescence Probes for Biological Research

2019· review· en· W2993699535 sur OpenAlexaff
Eugenio Gallo

Notice bibliographique

RevueBioconjugate Chemistry · 2019
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryFluorescenceBiophysicsNanotechnologyBiosensorCombinatorial chemistryBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Since their discovery, fluorescent probes have found widespread use in biological research. Over time, multiple next-generation probes increased the fluorescence catalog by offering novel capabilities of detection that have been previously difficult or lacking with conventional probes. One of such probes is called a fluorogen-activating protein (FAP). These are bimodular sensors, composed of a single-chain antibody that exhibits high-affinity and selectivity for small-molecule fluorogens. Because fluorogens are inherently nonfluorescent unless sterically restricted, upon the formation of the noncovalent FAP-fluorogen complex the fluorogen module emits fluorescence when excited by light. More interestingly, these bimodular sensors permit improvement of their biophysical properties. For instance, the fluorescence spectra and environmental sensing capabilities of fluorogens may be altered by the method of chemical modification at the fluorogen structural level. Also, optimizations of the single-chain antibody scaffold, via amino acid substitutions at the selectivity regions, may improve the detection brightness and affinities of fluorogens; this may also improve the biophysical stability of FAPs in different cellular environments. Additionally, when utilized as biological discovery probes, FAP biosensors exhibit functional activity as genetic fusion tags with cellular proteins; this results in high fluorescent sensitivities of cell surface and intracellular targets. Also, FAPs allow the monitoring of cellular traffic of surface receptors by fluorescence methods of real-time color switching, or signal onset and offset. They find application as biological probes integrated into biomaterials, or as soluble affinity reagents for whole live animal studies. Overall, this noncovalent activation of fluorogen particles results in advanced strategies of fluorescence detection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,505
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,311
Tête enseignante GPT0,427
Écart entre enseignants0,116 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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