Identification of Streptomycin Resistance Gene Among Enterococcus spp. Isolated from Hospitals of Tehran by PCR
Notice bibliographique
Résumé
Background and Aim: Enterococci are normal flora and present in the intestinal tract of humans and many mammals. Today, the increasing prevalence of resistant enterococci to aminoglycosides is a major problem in hospitals around the world. In Enterococci, aph (3 ') - IIIa gene plays a major role in the emergence of resistance to streptomycin. The aim of this study was to identify this gene in enterococci isolated from patients using PCR method in Tehran. Materials and Methods: In this study, 350 clinical samples were collected from Milad, Imam Khomeini, and Baghiyatallah hospitals during the years 2015-2014. Enterococcus species were identified based on specific biochemical tests and culture. Then, disk diffusion method was performed according to CLSI guidelines to determine the drug resistance of Enterococcus isolates to different antibiotics. The following primer to streptomycin resistance genes, aph (3 ') - IIIa was used in the PCR method. Results: Among the 150 samples, 87 samples (58%) were reported as Enterococcus faecalis, and 63 (42%) as Enterococcus faecium. In Antibiotic test, strains showed high resistance to tetracycline and erythromycin whereas the least resistance was observed to chloramphenicol and vancomycin, respectively. The high resistance to Streptomycin was in 22.2% strains which included aph (3') -IIIa gene. Conclusions: The results of this study can be concluded that the presence of aph (3') -IIIa gene is the main cause of antibiotic resistance to streptomycin in Enterococcus faecium and E. faecalis strains that is growing gradually in the hospitals in Tehran. Therefore, early detection of this type of resistance with the PCR method could be the best way to prevent the spread of infections caused by this bacterium.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».