229 Dysregulated axonal homeostasis in C9orf72 iPSC-derived motor neurones
Notice bibliographique
Résumé
Dysregulated axonal homeostasis is a potential pathomechanism in ALS, but its relevance to the commonest known genetic mutation in ALS – the C9orf72 repeat expansion – remains unclear. We performed unbiased transcriptomics of cell-autonomous C9orf72 motor neurone (MN) perturbations in a humanised model using patient-derived induced pluripotent stem-cell lines against an isogenic background generated by CRISPR/Cas9 and studied the functional consequences of downstream axonal hits. Differential gene expression analysis examined the intersection in differentially expressed genes between the mutant-isogene pairs, revealing 215 genes: 95 up and 120 down. Pathway analysis showed an axonal signature, with upregulation of pathways involved in cytoskeletal organisation, axon guidance, and Trk receptor signalling, and downregulation of pathways involved in the mitochondrial electron transport chain and axon guidance. Significantly dysregulated genes were confirmed using real-time quantitative PCR. This led to two hypotheses examining for aberrations in axonal length and transport. Axonal length was measured using manual tracking of SMI-312 labelled axons. Axonal transport was determined by tracking Ds-Red2 labelled mitochondrial movement using a live-imaging setup and analysed using KymoToolBox. Both axonal length and transport were reduced in the mutants compared to their isogenic counterparts. Further experiments are underway to determine whether common pharmacological manipulations can rescue both phenotypes.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».