Histological and molecular diversity and heterogeneity of precancerous lesions associated with inflammatory bowel diseases
Notice bibliographique
Résumé
Aims Inflammatory bowel disease (IBD)-associated precancerous lesions may be adenomatous or non-adenomatous with various histomorphologies. We aim to validate the newly proposed classification, to explore the neoplastic nature of the non-adenomatous lesions and to elucidate the molecular mechanisms underlying the different histomorphologies. Methods 44 background precursor lesions identified in 53 cases of surgically resected IBD-associated colorectal and ileal carcinomas were reviewed for the histomorphological features (classified into adenomatous, mucinous, sessile serrated adenoma (SSA)-like, traditional serrated adenoma-like, differentiated, eosinophilic and serrated not otherwise specified (NOS)) and analysed for a key panel of colonic cancer-related molecular markers. Results Approximately 60% of the lesions were adenomatous, of which some had mixed serrated, mucinous or eosinophilic changes. The remaining non-adenomatous lesions, including all other types except SSA-like type, mostly showed mixed features and focal adenomatous dysplasia. KRAS mutation and p53 mutant-type expression were found in about half cases across all types, while PIK3CA mutation only in some of adenomatous and eosinophilic lesions and MLH1/PMS2 loss in a subset of adenomatous, mucinous and eosinophilic but not in differentiated and serrated lesions. SAT-B2 or PTEN loss and IMP3 overexpression were seen in a small subset of lesions. No BRAF, NRAS or EGFR gene mutation was detected in any type. Certain molecular-morphological correlations were demonstrated; however, no single or combined molecular alteration(s) was specific to any particular morphological type. Conclusions IBD-associated precancerous lesions are heterogeneous both histologically and molecularly. True colitis-associated adenomatous lesions are unlikely conventional adenomas. Non-adenomatous lesions without frank cytologic dysplasia should also be regarded as neoplastic.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».