Incorporation of Boronic Acid into Aptamer-Based Molecularly Imprinted Hydrogels for Highly Specific Recognition of Adenosine
Notice bibliographique
Résumé
Molecularly imprinted polymers (MIPs) and aptamers are two types of molecular recognition strategies. We are interested in combining them to further improve specificity. Adenosine is a model analyte for developing aptamer-based biosensors, but the most commonly used DNA aptamer for adenosine can also bind deoxyadenosine with a similar affinity ( K a (adenosine)/ K a (deoxyadenosine) = 1.07). Since adenosine and deoxyadenosine differ by the former having a cis -diol, and boronic acid can bind cis -diol specifically, in this work, an acrydite-modified adenosine aptamer was copolymerized with a boronic acid containing monomer, 3-acrylamidophenylboronic acid (AAPBA) in the presence of adenosine as the template for imprinting. Isothermal titration calorimetry (ITC) and SYBR Green I staining were used to measure its binding. The AAPBA-containing aptamer-MIP exhibited a 115-fold high selectivity for adenosine against deoxyadenosine at pH 6.4, and 230-fold for adenosine against cytidine. We recently found that boronic acid containing hydrogels can nonspecifically adsorb DNA oligonucleotides and inhibit aptamer binding. The ribose in adenosine may interact with the boronic acid unit and decrease its inhibition effect to the aptamer in the MIP. However, for deoxyadenosine, it does not bear a cis -diol and thus cannot rescue the aptamer. This work provides insight into the combination of aptamers with other functional groups, which may further broaden applications in ways that free aptamers cannot achieve alone.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».