Expression Analysis of ATP-Binding Cassette Transporters ABCB11 and ABCB4 in Primary Sclerosing Cholangitis and Variety of Pediatric and Adult Cholestatic and Noncholestatic Liver Diseases
Notice bibliographique
Résumé
ATP-binding cassette (ABC) transporters are the members of the efflux pumps that are responsible for the removal of cytotoxic substances by active transport. ABCB11, the bile salt efflux pump of hepatocytes, coordinates cellular excretion of numerous conjugated bile salts into the bile canaliculi, whereas ABCB4 acts as an ATP-dependent floppase translocating phosphatidylcholine from the inner to the outer leaflet of the bile canalicular membrane. Loss of functional ABCB11 and ABCB4 proteins causes early-onset refractory cholestasis or cholangiopathy. In this study, we investigated the expression and localization pattern of ABCB11 and ABCB4 using immunohistochemistry and RNA profiling in liver samples from patients with different types and stages of chronic cholestatic liver disease, with emphasis on primary sclerosing cholangitis (PSC), compared to a variety of cholestatic and noncholestatic hepatopathies. Therefore, ABCB11 and ABCB4 expressions were investigated on formalin-fixed and paraffin-embedded (FFPE) material in a patient cohort of total 43 patients with or without cholestatic liver diseases, on protein level using immunohistochemistry and on RNA level using nanoString technology. Intriguingly, our results demonstrated increased expression of ABCB11 and ABCB4 on protein as well as RNA level in PSC, and the expression pattern correlated with disease progression. We concluded from our study that patients with PSC demonstrate altered expression levels and pattern of ABCB11 and ABCB4 which correlated with disease progression; thereby, ABCB11 and ABCB4 analysis may be a useful tool for assessment of disease stages in PSC.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».