MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2995275768 · doi:10.1101/870477

The Glyco-enzyme adaptor GOLPH3 Links Intra-Golgi Transport Dynamics to Glycosylation Patterns and Cell Proliferation

2019· preprint· en· W2995275768 sur OpenAlexfundno aff
Riccardo Rizzo, Domenico Russo, Kazuo Kurokawa, Pranoy Sahu, Bernadette Lombardi, Domenico Supino, M. Zhukovsky, Anthony Vocat, Prathyush Pothukuchi, Vidya Kunnathully, Laura Capolupo, Gaëlle Boncompain, Carlo Vitagliano, Federica Zito Marino, Gabriella Aquino, Daniela Montariello, Petra Henklein, Luigi Mandrich, Gerardo Botti, Henrik Clausen, Ulla Mandel, Toshiyuki Yamaji, Kentaro Hanada, Alfredo Budillon, Franck Perez, Seetharaman Parashuraman, Yusuf A. Hannun, Akihiko Nakano, Daniela Corda, Giovanni D’Angelo, Alberto Luini

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroFondazione per la Ricerca sulla Fibrosi CisticaMinistero dell’Istruzione, dell’Università e della RicercaÉcole Polytechnique Fédérale de LausanneFondazione Italiana per la Ricerca sul CancroStiftelsen Kristian Gerhard JebsenSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungNational Science Foundation
Mots-clésGolgi apparatusCell biologyGlycosylationGlycosphingolipidBiologySignal transducing adaptor proteinSignal transductionBiochemistryEndoplasmic reticulum

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Glycans are ubiquitous sugar polymers with major biological functions that are assembled by glyco-enzymes onto cargo molecules during their transport through the Golgi complex. How the Golgi determines glycan assembly is poorly understood. By relying on the Golgi cisternal maturation model and using the glyco-enzyme adaptor and oncoprotein GOLPH3 as a molecular tool, we define the first example of how the Golgi controls glycosylation and associated cell functions. GOLPH3, acting as a component of the cisternal maturation mechanism, selectively binds and recycles a subset of glyco-enzymes of the glycosphingolipid synthetic pathway, hinders their escape to the lysosomes and hence increases their levels through a novel lysosomal degradation-regulated mechanism. This enhances the production of specific growth-inducing glycosphingolipids and reprograms the glycosphingolipid pathway to potentiate mitogenic signaling and cell proliferation. These findings unravel unforeseen organizing principles of Golgi-dependent glycosylation and delineate a paradigm for glycan assembly by the Golgi transport mechanisms. Moreover, they indicate a new role of cisternal maturation as a regulator of glycosylation, and outline a novel mechanism of action for GOLPH3-induced proliferation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,190
Écart entre enseignants0,184 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)Même sujetCellular transport and secretionTravaux en français237 207