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Enregistrement W2995340058 · doi:10.4049/jimmunol.1900455

Stochastic Expansions Maintain the Clonal Stability of CD8+ T Cell Populations Undergoing Memory Inflation Driven by Murine Cytomegalovirus

2019· article· en· W2995340058 sur OpenAlexaff
Corinne J. Smith, Vanessa Venturi, Máire F. Quigley, Holly Turula, Emma Gostick, Kristin Ladell, Brenna J. Hill, Danielle Himelfarb, Kylie M. Quinn, Hui Yee Greenaway, Thurston H. Y. Dang, Robert A. Seder, Daniel C. Douek, Ann B. Hill, Miles P. Davenport, David A. Price, Christopher M. Snyder

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCytomegalovirus and herpesvirus research
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesWellcome Trust
Mots-clésBiologyCD8EpitopeCytotoxic T cellPopulationVirologyObligateSubdominantT cellCytomegalovirusChronic infectionImmunologyVirusImmune systemGeneticsCell biologyAntibodyViral diseaseHerpesviridaeEcologyDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract CMV is an obligate and persistent intracellular pathogen that continually drives the production of highly differentiated virus-specific CD8+ T cells in an Ag-dependent manner, a phenomenon known as memory inflation. Extensive proliferation is required to generate and maintain inflationary CD8+ T cell populations, which are counterintuitively short-lived and typically exposed to limited amounts of Ag during the chronic phase of infection. An apparent discrepancy therefore exists between the magnitude of expansion and the requirement for ongoing immunogenic stimulation. To address this issue, we explored the clonal dynamics of memory inflation. First, we tracked congenically marked OT-I cell populations in recipient mice infected with murine CMV (MCMV) expressing the cognate Ag OVA. Irrespective of numerical dominance, stochastic expansions were observed in each population, such that dominant and subdominant OT-I cells were maintained at stable frequencies over time. Second, we characterized endogenous CD8+ T cell populations specific for two classic inflationary epitopes, M38 and IE3. Multiple clonotypes simultaneously underwent Ag-driven proliferation during latent infection with MCMV. In addition, the corresponding CD8+ T cell repertoires were stable over time and dominated by persistent clonotypes, many of which also occurred in more than one mouse. Collectively, these data suggest that stochastic encounters with Ag occur frequently enough to maintain oligoclonal populations of inflationary CD8+ T cells, despite intrinsic constraints on epitope display at individual sites of infection with MCMV.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,000
Score d'incertitude au seuil0,001

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,296
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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