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Enregistrement W2995340918 · doi:10.1101/2019.12.18.880823

PRDM3 attenuates pancreatitis and pancreatic tumorigenesis by regulating inflammatory response

2019· preprint· en· W2995340918 sur OpenAlexafffund
Jie Ye, Anpei Huang, Haitao Wang, Anni Zhang, Xiaojun Huang, Qingping Lan, Tomohiko Sato, Susumu Goyama, Mineo Kurokawa, Chu‐Xia Deng, Maike Sander, David F. Schaeffer, Wen Li, Janel L. Kopp, Ruiyu Xie

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic and Hepatic Oncology Research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchFundo para o Desenvolvimento das Ciências e da TecnologiaUniversidade de MacauNational Natural Science Foundation of ChinaNational Institutes of HealthVanderbilt University
Mots-clésAcinar cellPancreasPancreatitisKRASCancer researchCarcinogenesisCeruletideBiologyInflammationPancreatic cancerDuctal cellsEndocrinologyInternal medicineDownregulation and upregulationMedicineCancerReceptorCholecystokinin

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is associated with metaplastic changes in the pancreas but the transcriptional program underlying these changes is incompletely understood. The zinc finger transcription factor, PRDM3, is lowly expressed in normal pancreatic acini and its expression increases during tumorigenesis. Although PRDM3 promotes proliferation and migration of PDAC cell lines, the role of PRDM3 during tumor initiation from pancreatic acinar cells in vivo is unclear. In this study, we showed that high levels of PRDM3 expression in human pancreas was associated with pancreatitis, and well-differentiated but not poorly differentiated carcinoma. We examined PRDM3 function in pancreatic acinar cells during tumor formation and pancreatitis by inactivating Prdm3 using a conditional allele ( Ptf1a CreER ;Prdm3 flox/flox mice) in the context of oncogenic Kras expression and supraphysiological cerulein injections, respectively. In Prdm3 -deficient mice, Kras G12D -driven preneoplastic lesions were more abundant and progressed to high-grade precancerous lesions more rapidly. This is consistent with our observations that low levels of PRDM3 in human PDAC was correlated significantly with poorer survival in patient. Moreover, loss of Prdm3 in acinar cells elevated exocrine injury, enhanced immune cell activation and infiltration, and greatly increased acinar-to-ductal cell reprogramming upon cerulein-induced pancreatitis. Whole transcriptome analyses of Prdm3 knockout acini revealed that pathways involved in inflammatory response and Hif-1 signaling were significantly upregulated in Prdm3 -depleted acinar cells. Taken together, our results suggest that Prdm3 favors the maintenance of acinar cell homeostasis through modulation of their response to inflammation and oncogenic Kras activation, and thus plays a previously unexpected suppressive role during PDAC initiation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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