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Enregistrement W2995384463 · doi:10.1093/pcp/pcz224

Identification of α-Tomatine 23-Hydroxylase Involved in the Detoxification of a Bitter Glycoalkaloid

2019· article· en· W2995384463 sur OpenAlexfundno aff
Masaru Nakayasu, Ryota Akiyama, Midori Kobayashi, Hyoung Jae Lee, Takashi Kawasaki, Bunta Watanabe, Shingo Urakawa, Junpei Kato, Yukihiro Sugimoto, Yoko Iijima, Kazuki Saito, Toshiya Muranaka, Naoyuki Umemoto, Masaharu Mizutani

Notice bibliographique

RevuePlant and Cell Physiology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePotato Plant Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesSwine Innovation Porc
Mots-clésGlycoalkaloidRipeningSolanumBiochemistryEnzymeBiologySolanaceaeChemistryBotanyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Tomato plants (Solanum lycopersicum) contain steroidal glycoalkaloid α-tomatine, which functions as a chemical barrier to pathogens and predators. α-Tomatine accumulates in all tissues and at particularly high levels in leaves and immature green fruits. The compound is toxic and causes a bitter taste, but its presence decreases through metabolic conversion to nontoxic esculeoside A during fruit ripening. This study identifies the gene encoding a 23-hydroxylase of α-tomatine, which is a key to this process. Some 2-oxoglutarate-dependent dioxygenases were selected as candidates for the metabolic enzyme, and Solyc02g062460, designated Sl23DOX, was found to encode α-tomatine 23-hydroxylase. Biochemical analysis of the recombinant Sl23DOX protein demonstrated that it catalyzes the 23-hydroxylation of α-tomatine and the product spontaneously isomerizes to neorickiioside B, which is an intermediate in α-tomatine metabolism that appears during ripening. Leaves of transgenic tomato plants overexpressing Sl23DOX accumulated not only neorickiioside B but also another intermediate, lycoperoside C (23-O-acetylated neorickiioside B). Furthermore, the ripe fruits of Sl23DOX-silenced transgenic tomato plants contained lower levels of esculeoside A but substantially accumulated α-tomatine. Thus, Sl23DOX functions as α-tomatine 23-hydroxylase during the metabolic processing of toxic α-tomatine in tomato fruit ripening and is a key enzyme in the domestication of cultivated tomatoes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,621
Score d'incertitude au seuil0,074

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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