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Enregistrement W2995871610 · doi:10.1097/pgp.0000000000000654

Interlaboratory Concordance of ProMisE Molecular Classification of Endometrial Carcinoma Based on Endometrial Biopsy Specimens

2019· article· en· W2995871610 sur OpenAlexaffabout
Anna Plotkin, Boris Kuzeljevic, Vanessa de Villa, Emily F. Thompson, C. Blake Gilks, Blaise Clarke, Martin Köbel, Jessica N. McAlpine

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Gynecological Pathology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEndometrial and Cervical Cancer Treatments
Établissements canadiensTrillium Health CentreUniversity of TorontoUniversity of CalgaryUniversity of British ColumbiaUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésConcordanceMSH6BiopsyPMS2CarcinomaMedicinePathologyOncologyInternal medicineCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Molecular classifiers improve the consistency of categorization of endometrial carcinoma and provide valuable prognostic information. We aimed to evaluate the interlaboratory agreement in ProMisE assignment across 3 dedicated Canadian gynecologic oncology centers. Fifty cases of endometrial carcinoma diagnosed on biopsy were collected from 3 centers and 3 unstained sections were provided to each participating site so that immunohistochemistry for MSH6, PMS2, and p53 could be performed and interpreted at each center, blinded to the original diagnoses and the results from other centers. A core was taken for DNA extraction and POLE mutation testing. Overall accuracy and κ statistic were assessed. MSH6, PMS2, and p53 could be assessed for all 50 cases, with agreement for 140/150 results. There was a high level of agreement in molecular classification (κ=0.82), overall. Cases with a discordant result for one of the features used in classification (n=10) were reviewed independently and the most common reason for disagreement was attributable to the weak p53 staining in 1 laboratory (n=4). Interpretive error in PMS2 (n=1) and MSH6 (n=2) assessment accounted for 3 of the remaining disagreements. Interpretive error in the assessment of p53 was identified in 2 cases, with very faint p53 nuclear reactivity being misinterpreted as wild-type staining. These results show strong interlaboratory agreement and the potential for greater agreement if technical and interpretive factors are addressed. Several solutions could improve concordance: central quality control to ensure technical consistency in immunohistochemical staining, education to decrease interpretation errors, and the use of secondary molecular testing.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,529
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,311
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations42
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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