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Enregistrement W2995956844 · doi:10.7939/r3-0cxw-sd02

Longitudinal Transmission of Campylobacter jejuni Subtypes throughout the Broiler Chicken Production Continuum

2019· article· en· W2995956844 sur OpenAlexaboutno aff
Nahal Ramezani

Notice bibliographique

RevueUniversity of Alberta Library · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSalmonella and Campylobacter epidemiology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCampylobacter jejuniBroilerCampylobacterBiologyTransmission (telecommunications)Food scienceComputer scienceBacteriaGeneticsTelecommunications

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The broiler chicken production continuum (including three commercial broiler farms, abattoir and retail poultry stream) was sampled longitudinally over a 542-day period in Southwestern Alberta (SWA) as a model agroecosystem. Furthermore, fecal samples collected from beef cattle in a confined feeding operation adjacent to one of the broiler farms, and stools from diarrheic human beings in SWA were collected during the sampling period. Campylobacter jejuni isolates were recovered from chickens using two methods (i.e. direct plating and enrichment/membrane filtration). Presumptive Campylobacter isolates from chickens, beef cattle, and diarrheic human beings were identified by taxon-specific polymerase chain reaction, and C. jejuni isolates were genotyped using a high resolution comparative genome fingerprinting method. The results showed that C. jejuni outbreaks were uncommon events in broiler farms. When infections occurred, they happened late in the production cycle, and typically in the spring and summer. When a flock was exposed to C. jejuni, the entire flock rapidly become colonized by a limited number of subtypes. Subtype diversity increased from farm to abattoir and retail. In many instances, birds deemed free of C. jejuni in the farms became contaminated during transport to and within the abattoir. Only a subset of C. jejuni subtypes isolated from broilers and poultry meat were deemed to represent a significant risk to human health. A high prevalence of beef cattle adjacent to one of the poultry farm sampled frequently shed diverse C. jejuni subtypes in their feces, including subtypes that infect people. Furthermore, C. jejuni subtypes responsible for outbreaks in chickens were observed in feces from steers in the feedlot, implicating beef cattle as an important reservoir of C. jejuni infecting broiler chickens. In conclusion, study findings showed that a relatively small number of birds are able to contaminate the abattoir with diverse C. jejuni subtypes, and clean birds are infested with these subtypes within the abattoir, which are subsequently transferred to retail meat. Importantly, only a subset of C. jejuni strains pose a risk to human health, and efforts to reduce the burden of foodborne C. jejuni on human beings should focus on mitigation of high risk subtypes within the abattoir.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,289
Score d'incertitude au seuil0,575

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,190
Écart entre enseignants0,178 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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