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Enregistrement W2996076484 · doi:10.1186/s13287-019-1516-2

A comprehensive proteomics profiling identifies NRP1 as a novel identity marker of human bone marrow mesenchymal stromal cell-derived small extracellular vesicles

2019· article· en· W2996076484 sur OpenAlex
Afnan Munshi, Jelica Mehic, Marybeth Creskey, Jonathan Gobin, Jun Gao, Emma Rigg, Gauri Muradia, Christian Luebbert, Carole Westwood, Andrew Stalker, David Allan, Michael Johnston, Terry D. Cyr, Michael Rosu‐Myles, Jessie R. Lavoie

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueStem Cell Research & Therapy · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueExtracellular vesicles in disease
Établissements canadiensCarleton UniversityUniversity of OttawaHealth Canada
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthUniversity of Ottawa
Mots-clésMesenchymal stem cellExosomeMicrovesiclesNanoparticle tracking analysisCell biologyMicrovesicleStromal cellChemistryStem cellCD44Paracrine signallingProteomicsExtracellular vesicleQuantitative proteomicsHoming (biology)BiologyMolecular biologyCellBiochemistryCancer research

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Clinical applications have shown extracellular vesicles (EVs) to be a major paracrine effector in therapeutic responses produced by human mesenchymal stromal/stem cells (hMSCs). As the regenerative capacity of EVs is mainly ascribed to the transfer of proteins and RNA composing its cargo, and to the activity attributed by the protein surface markers, we sought to profile the protein composition of small EVs released from hMSCs to identify hMSC-EV biomarkers with potential clinical relevance. METHODS: Small EVs were produced and qualified from five human bone marrow MSC donors at low passage following a 48-h culture in exosome-depleted medium further processed by steps of centrifugation, filtration, and precipitation. Quantitative proteomic analysis comparing the protein profile of the EVs released from hMSCs and their parental cell was conducted using tandem mass tag labeling combined to mass spectrometry (LC-MS/MS) to identify enriched EV protein markers. RESULTS: /mL), with the mode particle size measuring at 109.3 ± 5.7 nm. Transmission electron microscopy confirmed the presence of nanovesicles with bilayer membranes. Flow cytometric analysis identified commonly found exosomal (CD63/CD81) and hMSC (CD105/CD44/CD146) markers from released EVs in addition to surface mediators of migration (CD29 and MCSP). Quantitative proteomic identified 270 proteins significantly enriched by at least twofold in EVs released from hMSCs as compared to parental hMSCs, where neuropilin 1 (NRP1) was identified among 21 membrane-bound proteins regulating the migration and invasion of cells, as well as chemotaxis and vasculogenesis. Validation by western blot of multiple batches of EVs confirmed consistent enrichment of NRP1 in the nanovesicles released from all five hMSC donors. CONCLUSION: The identification and verification of NRP1 as a novel enriched surface marker from multiple batches of EVs derived from multiple hMSC donors may serve as a biomarker for the assessment and measurement of EVs for therapeutic uses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,322
Écart entre enseignants0,275 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle