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Enregistrement W2996192078 · doi:10.1101/2019.12.19.883017

Detection of transient neurotransmitter response using personalized neural networks

2019· preprint· en· W2996192078 sur OpenAlexafffund
Ivan S. Klyuzhin, Connor Bevington, Ju-Chieh Cheng, Vesna Sossi

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMedical Imaging Techniques and Applications
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésArtificial intelligenceVoxelArtificial neural networkPattern recognition (psychology)Standard test imageComputer scienceRacloprideNoise (video)Parametric statisticsFalse positive rateImage processingMathematicsImage (mathematics)StatisticsDopaminergicBiologyNeuroscienceDopamine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A bstract Measurement of stimulus-induced dopamine release and other types of transient neurotransmitter response (TNR) from dynamic PET images typically suffers from limited detection sensitivity and high false positive rates. Measurement of TNR of a voxel-level can be particularly problematic due to high image noise. In this work, we perform voxel-level TNR detection using artificial neural networks (ANN) and compare their performance to previously used standard statistical tests. Different ANN architectures were trained and tested using simulated and real human PET imaging data, obtained with the tracer [ 11 C]raclopride (a D2 receptor antagonist). A distinguishing feature of our approach is the use of “personalized” ANNs that are designed to operate on the image from a specific subject and scan. Training of personalized ANNs was performed using simulated images that have been matched with the acquired image in terms of the signal and noise. In our tests of TNR detection performance, the F-test of the linear parametric neurotransmitter PET (lp-ntPET) model fit residuals was used as the reference method. For a moderate TNR magnitude, the areas under the receiver operating characteristic curves in simulated tests were 0.64 for the F-test and 0.77–0.79 for the best ANNs. At a fixed false positive rate of 0.01, the true positive rates were 0.6 for the F-test and 0.8–0.9 for the ANNs. When applied to a real image, the ANNs identified a TNR cluster missed by the F-test. The newly found cluster was verified to contain TNR by direct lp-ntPET model fitting. These results demonstrate that personalized ANNs may offer a greater detection sensitivity of dopamine release and other types of TNR compared to previously used methods.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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