MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2996406729 · doi:10.3390/ijms20246279

Structural Insights into the Intracellular Region of the Human Magnesium Transport Mediator CNNM4

2019· article· en· W2996406729 sur OpenAlexafffund
Paula Giménez-Mascarell, Iker Oyenarte, Irene González‐Recio, Carmen Fernández‐Rodríguez, María Ángeles Corral-Rodríguez, Igone Campos-Zarraga, Jorge Simón, Elie Kostantin, Serge Hardy, Antonio Dı́az-Quintana, Mara Zubillaga Lizeaga, Nekane Merino, Tammo Diercks, Francisco J. Blanco, Irene Díaz‐Moreno, Maria Luz Martínez‐Chantar, Michel L. Tremblay, Dominik Müller, Dritan Siliqi, Luis Alfonso Martínez‐Cruz

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Molecular Sciences · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueMagnesium in Health and Disease
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesBerrikuntza + Ikerketa + Osasuna Eusko FundazioaInstituto de Salud Carlos IIIBerlin Institute of HealthEuropean Synchrotron Radiation FacilityMinisterio de Asuntos Económicos y Transformación Digital, Gobierno de EspañaMinisterio de Economía y CompetitividadBanco Bilbao Vizcaya ArgentariaDiputación Foral de BizkaiaEusko JaurlaritzaDiamond Light SourceFundación Ramón ArecesMinisterio de Ciencia e InnovaciónCanadian Institutes of Health ResearchFundación BBVA“la Caixa” Foundation
Mots-clésIntracellularChemistryCell biologyDimerBiophysicsBiologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The four member family of “Cyclin and Cystathionine β-synthase (CBS) domain divalent metal cation transport mediators”, CNNMs, are the least-studied mammalian magnesium transport mediators. CNNM4 is abundant in the brain and the intestinal tract, and its abnormal activity causes Jalili Syndrome. Recent findings show that suppression of CNNM4 in mice promotes malignant progression of intestinal polyps and is linked to infertility. The association of CNNM4 with phosphatases of the regenerating liver, PRLs, abrogates its Mg2+-efflux capacity, thus resulting in an increased intracellular Mg2+ concentration that favors tumor growth. Here we present the crystal structures of the two independent intracellular domains of human CNNM4, i.e., the Bateman module and the cyclic nucleotide binding-like domain (cNMP). We also derive a model structure for the full intracellular region in the absence and presence of MgATP and the oncogenic interacting partner, PRL-1. We find that only the Bateman module interacts with ATP and Mg2+, at non-overlapping sites facilitating their positive cooperativity. Furthermore, both domains dimerize autonomously, where the cNMP domain dimer forms a rigid cleft to restrict the Mg2+ induced sliding of the inserting CBS1 motives of the Bateman module, from a twisted to a flat disk shaped dimer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueInternational Journal of Molecular SciencesMême sujetMagnesium in Health and DiseaseTravaux en français237 207