Cloning and Partial Characterization of an Endo-α-(1→6)-d-Mannanase Gene from Bacillus circulans
Notice bibliographique
Résumé
Mycobacteria produce two major lipoglycans, lipomannan (LM) and lipoarabinomannan (LAM), whose broad array of biological activities are tightly related to the fine details of their structure. However, the heterogeneity of these molecules in terms of internal and terminal covalent modifications and complex internal branching patterns represent significant obstacles to their structural characterization. Previously, an endo-α-(1→6)-D-mannanase from Bacillus circulans proved useful in cleaving the mannan backbone of LM and LAM, allowing the reducing end of these molecules to be identified as Manp-(1→6) [Manp-(1→2)]-Ino. Although first reported 45 years ago, no easily accessible form of this enzyme was available to the research community, a fact that may in part be explained by a lack of knowledge of its complete gene sequence. Here, we report on the successful cloning of the complete endo-α-(1→6)-D-mannanase gene from Bacillus circulans TN-31, herein referred to as emn. We further report on the successful production and purification of the glycosyl hydrolase domain of this enzyme and its use to gain further insight into its substrate specificity using synthetic mannoside acceptors as well as LM and phosphatidyl-myo-inositol mannoside precursors purified from mycobacteria.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».