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Enregistrement W2996889063 · doi:10.2196/16492

Analyzing Medical Research Results Based on Synthetic Data and Their Relation to Real Data Results: Systematic Comparison From Five Observational Studies

2019· article· en· W2996889063 sur OpenAlexvenueno aff
Anat Reiner‐Benaim, Ronit Almog, Yuri Gorelik, Irit Hochberg, Laila Nassar, Tanya Mashiach, Mogher Khamaisi, Yael Lurie, Zaher S. Azzam, Johad Khoury, Daniel Kurnik, Rafael Beyar

Notice bibliographique

RevueJMIR Medical Informatics · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiquePrivacy-Preserving Technologies in Data
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSynthetic dataComputer scienceData miningObservational studyProcess (computing)Relation (database)StatisticsArtificial intelligenceMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Privacy restrictions limit access to protected patient-derived health information for research purposes. Consequently, data anonymization is required to allow researchers data access for initial analysis before granting institutional review board approval. A system installed and activated at our institution enables synthetic data generation that mimics data from real electronic medical records, wherein only fictitious patients are listed. OBJECTIVE: This paper aimed to validate the results obtained when analyzing synthetic structured data for medical research. A comprehensive validation process concerning meaningful clinical questions and various types of data was conducted to assess the accuracy and precision of statistical estimates derived from synthetic patient data. METHODS: A cross-hospital project was conducted to validate results obtained from synthetic data produced for five contemporary studies on various topics. For each study, results derived from synthetic data were compared with those based on real data. In addition, repeatedly generated synthetic datasets were used to estimate the bias and stability of results obtained from synthetic data. RESULTS: This study demonstrated that results derived from synthetic data were predictive of results from real data. When the number of patients was large relative to the number of variables used, highly accurate and strongly consistent results were observed between synthetic and real data. For studies based on smaller populations that accounted for confounders and modifiers by multivariate models, predictions were of moderate accuracy, yet clear trends were correctly observed. CONCLUSIONS: The use of synthetic structured data provides a close estimate to real data results and is thus a powerful tool in shaping research hypotheses and accessing estimated analyses, without risking patient privacy. Synthetic data enable broad access to data (eg, for out-of-organization researchers), and rapid, safe, and repeatable analysis of data in hospitals or other health organizations where patient privacy is a primary value.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,195
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,409
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,805
Score d'incertitude au seuil0,993

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1950,409
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,009
Bibliométrie0,0150,009
Études des sciences et des technologies0,0010,003
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0020,003
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,249
Tête enseignante GPT0,432
Écart entre enseignants0,183 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeObservationnel
DomaineMéthodes
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations143
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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