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Enregistrement W2997597287 · doi:10.21608/scvmj.2014.65859

Aquatic Environments and Spectral Sensitivity of Rod Visual Pigments in the Retina of Rainbow Trout (Oncorhynchus mykiss): A Microspectrophotometric Study

2014· article· en· W2997597287 sur OpenAlexafffund
Hamdy M. Embark, Craig W. Hawryshyn

Notice bibliographique

RevueSuez Canal Veterinary Medicine Journal SCVMJ · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinal Development and Disorders
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesSouth Valley UniversityQueen's University
Mots-clésRainbow troutOpsinChromophoreSpectral sensitivityRetinaAbsorbancePigmentRetinalBiologyTroutRhodopsinBiophysicsAnatomyWavelengthOpticsChemistryBiochemistryPhotochemistryChromatographyFish <Actinopterygii>NeurosciencePhysicsFishery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The vertebrate retina is a part of the central nervous system (CNS) that can be visualized in a non-invasive manner. The retina is a thin multi-layered sensory tissue of neural cells that contains millions of photoreceptors. There are two physiologically distinct types of photoreceptors across the retina, the cones and the rods. The light sensitivity of the photoreceptors results from the presence of visual pigment molecules in the outer segment of the cone and rod cells. All visual pigments are composed of two components: retinal (vitamin A aldehyde), termed a chromophore, bound to a protein called opsin. The spectral absorption properties of a visual pigment are mainly determined by the amino acid sequence of the opsin protein and the type of chromophore (A1 or A2 or mixed) bound to the opsin. There is a shifting from A1- to A2-based chromophores in the same opsin due to different environmental factors, e.g. aquatic environments. A1/A2 visual pigment ratios play a dominant role in determining rod λmax in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss), shifting the λmax of the visual pigment and spectral bandwidth of absorbance (HBW, half-band width). The spectral absorption characteristics of the retinal rod photoreceptors in the Rainbow Trout (Oncorhynchus mykiss) were measured using the charge-coupled device (CCD)- based microspectrophotometer (MSP) system. We investigated retina preparations of juvenile rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) using 54 rod photoreceptors. The spectral sensitivity of each rod photoreceptor was calculated using λmax (wavelength of maximum absorbance) and HBW. The mean wavelength of maximum absorbance values for the alpha-bands were 503.5±2.5nm for rhodopsin- dominated rods, 523.1±7.9nm for porphyropsin-dominated rods, and 509.6±1.9nm for rhodopsin porphyropsin mixed rods. The half-band width (HBW) of the main absorption bands was 4567±771 cm-1 for vitamin A1-based visual pigments and 4697±487 cm-1 for vitamin A2-based visual pigments. Our results provide the evidence of shifting the λmax of the visual pigment to a longer wavelength, broadening spectral bandwidth of absorbance, and presence three fundamentally different classes of rod photoreceptors in the retina of the rainbow trout depending on A1/A2 visual pigment ratios due to different environmental variables, e.g. aquatic environments.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,774
Score d'incertitude au seuil0,511

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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