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Enregistrement W2997675468 · doi:10.1101/2021.08.11.455880

Identification of Subpallial Neuronal Populations Across Zebrafish Larval Stages that Express Molecular Markers for the Striatum

2021· preprint· en· W2997675468 sur OpenAlexaff
Vernie Aguda, Helen Chasiotis, Indira Riadi, Tod R. Thiele

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueZebrafish Biomedical Research Applications
Établissements canadiensThe Scarborough HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésZebrafishStriatumBiologyIn situ hybridizationImmunostainingPopulationVertebrateNeuroscienceDanioGeneEnkephalinCell biologyImmunohistochemistryGeneticsGene expressionDopamineReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Striatal neurons play a central role in vertebrate action selection; however, their location in larval zebrafish is not well defined. We assayed for conserved striatal markers in the zebrafish subpallium using fluorescent in situ hybridization (FISH) and immunohistochemistry. Whole mount FISH revealed an inhibitory neuronal cluster rostral to the anterior commissure that expresses tac1 , a gene encoding substance P. This molecular profile is shared by mammalian striatal direct pathway neurons. A second partially overlapping population of inhibitory neurons was identified that expresses penka , a gene encoding enkephalin. This molecular profile is shared by striatal indirect pathway neurons. Immunostaining for substance P and enkephalin confirmed the presence of these peptides in the subpallium. The tac1 and penka populations were both found to increase linearly across larval stages. Together, these findings support the existence of a striatal homologue in larval zebrafish that grows to match the development and increasing behavioural complexity of the organism.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,112
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,292
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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