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Enregistrement W2997714724 · doi:10.1016/j.ymgmr.2019.100556

Gene interactions observed with the HDL-c blood lipid, intakes of protein, sugar and biotin in relation to circulating homocysteine concentrations in a group of black South Africans

2019· article· en· W2997714724 sur OpenAlexfundno aff
Jacomina P. du Plessis, Alida Melse‐Boonstra, Lizelle Zandberg, Cornelie Nienaber‐Rousseau

Notice bibliographique

RevueMolecular Genetics and Metabolism Reports · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFolate and B Vitamins Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilSouth Africa Netherlands research Programme on Alternatives in DevelopmentPopulation Health Research InstituteNational Research FoundationHamilton Health SciencesMcMaster University
Mots-clésMethylenetetrahydrofolate reductaseHomocysteineCystathionine beta synthaseHyperhomocysteinemiaSingle-nucleotide polymorphismGenotypeEndocrinologyInternal medicineBiologyHeterozygote advantageAlleleMethionine synthaseMethionineGeneticsMedicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Elevated homocysteine (Hcy) is associated with several pathologies. Gene–diet interactions related to Hcy might be used to customize dietary advice to reduce disease incidence. To explore this possibility, we investigated interactions between anthropometry, biochemical markers and diet and single-nucleotide polymorphisms (SNPs) in relation to Hcy concentrations. Five SNPs of Hcy-metabolizing enzymes were analyzed in 2010 black South Africans. Hcy was higher with each additional methylenetetrahydrofolate reductase (MTHFR) C677T minor allele copy, but was lower in methionine synthase (MTR) 2756AA homozygotes than heterozygotes. Individuals harboring cystathionine β synthase (CBS) 833 T/844ins68 had lower Hcy concentrations than others. No interactive effects were observed with any of the anthropometrical markers. MTHFR C677T and CBS T833C/844ins68 homozygote minor allele carriers presented with lower Hcy as high density lipoprotein cholesterol (HDL-c) increased. Hcy concentrations were negatively associated with dietary protein and animal protein intake in the TT and TC genotypes, but positively in the CC genotype of CBS T833C/844ins68. Hcy was markedly higher in TT homozygotes of MTHFR C677T as added sugar intake increased. In CBS T833C/844ins68 major allele carriers, biotin intake was negatively associated with Hcy; but positively in those harboring the homozygous minor allele. The Hcy–SNP associations are modulated by diet and open up the possibility of invoking dietary interventions to treat hyperhomocysteinemia. Future intervention trials should further explore the observed gene–diet and gene–blood lipid interactions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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