Tuberculosis drug resistance in Canada: 2018
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Drug-resistant tuberculosis (TB) is a public health issue of global importance that poses a threat to TB control efforts. Canada conducts nationwide surveillance to monitor emerging drug resistance trends and document progress towards reaching the goal of TB elimination. OBJECTIVE: To describe TB drug resistance trends across Canada from 2008-2018, with a focus on 2018, by drug resistance, geographic and demographic patterns. METHODS: TB drug resistance data are captured through two independent surveillance systems managed by the Public Health Agency of Canada: Canadian Tuberculosis Laboratory Surveillance System (CTBLSS) and the Canadian Tuberculosis Reporting System (CTBRS). Data from these systems were analyzed and descriptive statistics were reported by resistance profile, place of residence (province), age groups, sex and country of birth. RESULTS: In 2018, 1,459 TB isolates underwent drug susceptibility testing, a 4.3% decrease from 2017. Resistance to any first-line drug was reported in 148 isolates (10.1%), compared to 123 (8.1%) in 2017. Of these, 121 were monoresistant, five were polyresistant, 21 were multidrug-resistant tuberculosis (MDR-TB) and one was extensively drug-resistant TB (XDR-TB). Drug resistance was reported in all provinces and territories except Prince Edward Island, Northwest Territories and Yukon. Among individuals younger than 15 years, very little TB drug resistance was detected. Among individuals aged 15 years and older, the distribution of TB drug resistance varied with no discernable trends. The proportion of drug resistance was slightly higher in females than in males. By origin, 10.7% of foreign-born TB cases reported between 2006 and 2016 were drug-resistant. Among the Canadian-born non-Indigenous cases, 9.3% were drug resistant; among Canadian-born Indigenous, 2.4% were drug resistant. CONCLUSION: In 2018, the proportion of isolates with TB drug resistance in Canada remained low and below global averages, with stable drug resistance, both geographically and demographically.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,006 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,010 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».