The Xylella fastidiosa-Resistant Olive Cultivar “Leccino” Has Stable Endophytic Microbiota during the Olive Quick Decline Syndrome (OQDS)
Notice bibliographique
Résumé
Xylella fastidiosa is a highly virulent pathogen that causes Olive Quick Decline Syndrome (OQDS), which is currently devastating olive plantations in the Salento region (Apulia, Southern Italy). We explored the microbiome associated with X. fastidiosa-infected (Xf-infected) and -uninfected (Xf-uninfected) olive trees in Salento, to assess the level of dysbiosis and to get first insights into the potential role of microbial endophytes in protecting the host from the disease. The resistant cultivar “Leccino” was compared to the susceptible cultivar “Cellina di Nardò”, in order to identify microbial taxa and parameters potentially involved in resistance mechanisms. Metabarcoding of 16S rRNA genes and fungal ITS2 was used to characterize both total and endophytic microbiota in olive branches and leaves. “Cellina di Nardò” showed a drastic dysbiosis after X. fastidiosa infection, while “Leccino” (both infected and uninfected) maintained a similar microbiota. The genus Pseudomonas dominated all “Leccino” and Xf-uninfected “Cellina di Nardò” trees, whereas Ammoniphilus prevailed in Xf-infected “Cellina di Nardò”. Diversity of microbiota in Xf-uninfected “Leccino” was higher than in Xf-uninfected “Cellina di Nardò”. Several bacterial taxa specifically associated with “Leccino” showed potential interactions with X. fastidiosa. The maintenance of a healthy microbiota with higher diversity and the presence of cultivar-specific microbes might support the resistance of “Leccino” to X. fastidiosa. Such beneficial bacteria might be isolated in the future for biological treatment of the OQDS.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».