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Enregistrement W2997980717 · doi:10.2147/idr.s236766

<p>Emergence of Almost Identical F36:A-:B32 Plasmids Carrying <em>bla</em><sub>NDM-5</sub> and <em>qepA</em> in <em>Escherichia coli </em>from Both Pakistan and Canada</p>

2019· article· en· W2997980717 sur OpenAlex
Zulqarnain Baloch, Luchao Lv, Lingxian Yi, Miao Wan, Bilal Aslam, Jun Yang, Jian–Hua Liu

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueInfection and Drug Resistance · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésPlasmidEscherichia coliBiologyEnterobacteriaceaeMicrobiologyMinionNanopore sequencingGeneGenomeGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract: The New Delhi Metallo-β-lactamase (NDM) producing Enterobacteriaceae is spreading worldwide. Although the bla NDM gene has been identified in animal associated Enterobacteriaceae isolates in many countries, little is known about its occurrence in animal products in Pakistan. In this study, 13 Escherichia coli isolates were collected from chicken meat samples in Pakistan. Two isolates, 15978 and C4109, exhibited reduced susceptibility (MIC ≥1 μg/mL) to imipenem, and carried bla NDM-5 and bla NDM-7 gene, respectively. Whole-genome sequencing and Oxford Nanopore MinION sequencing revealed that 15978 and C4109 belonged to ST156 and ST167, respectively. bla NDM-7 was carried by an IncX3 plasmid that has disseminated worldwide, whereas bla NDM-5 was located on an F36: A-: B32 plasmid, which shared high identity with two plasmids carried by E. coli isolates from other countries (one from a patient in Canada). To the best of our knowledge, this is the first report characterizing bla NDM -carrying plasmids from chicken meat samples in Pakistan. The dissemination of almost identical bla NDM-5 -bearing F36:A-:B32 and bla NDM-7 -bearing IncX3 plasmids in different countries highlights the importance of international trade and travel in the spread of antimicrobial resistance strains and plasmids worldwide. Keywords: plasmid, animal food, carbapenemase, bla NDM

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Études des sciences et des technologies, Communication savante, Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesMéta-épidémiologie (sens strict)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,748
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,004
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0020,002
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle