MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2998002920 · doi:10.1101/2020.01.06.895839

Material-Driven Fibronectin Assembly Rescues Matrix Defects due to Mutations in Collagen IV in Fibroblasts

2020· preprint· en· W2998002920 sur OpenAlexaff
Elie Ngandu Mpoyi, Marco Cantini, Yuan Yan Sin, Lauren Fleming, Dennis W. Zhou, Mercedes Costell, Yinhui Lu, Karl E. Kadler, Andrés J. Garcı́a, Tom Van Agtmael, Manuel Salmerón‐Sánchez

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCell Adhesion Molecules Research
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesEngineering and Physical Sciences Research Council
Mots-clésFibronectinLamininPhenotypeCell biologyExtracellular matrixMutationChemistryCell adhesionCellBiologyGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Basement membranes (BMs) provide structural support to tissues and influence cell signaling. Mutations in COL4A1/COL4A2, a major BM component, cause eye, kidney and cerebrovascular disease, including stroke. Common variants in these genes are risk factors for intracerebral hemorrhage in the general population. However, the contribution of the matrix to the disease mechanism(s) and its effects on the biology of cells harboring a collagen IV mutation remain poorly understood. To shed light on this, we engineered controlled microenvironments using polymer biointerfaces coated with ECM proteins laminin or fibronectin (FN), to investigate the cellular phenotype of primary fibroblasts harboring a COL4A2 +/G702D mutation. FN nanonetworks assembled on poly(ethyl acrylate) (PEA) induced increased deposition and assembly of collagen IV in COL4A2 +/G702D cells, which was associated with reduced ER size and enhanced levels of protein chaperones such as BIP, suggesting increased protein folding capacity of cells. FN nanonetworks on PEA also partially rescued the reduced stiffness of the deposited matrix and cells, and enhanced cell adhesion through β 1 -mediated signaling and actin-myosin contractility, effectively rescuing some of the cellular phenotypes associated with COL4A1/4A2 mutations. Collectively, these results suggest that biomaterials are able to shape the matrix and cellular phenotype of the COL4A2 +/G702D mutation in patient-derived cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)Même sujetCell Adhesion Molecules ResearchTravaux en français237 207