MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2998186445 · doi:10.1534/genetics.119.302740

Mating-Type-Specific Ribosomal Proteins Control Aspects of Sexual Reproduction in <i>Cryptococcus neoformans</i>

2019· article· en· W2998186445 sur OpenAlexfundno aff
Giuseppe Ianiri, Yufeng Fang, Tim A. Dahlmann, Shelly Applen Clancey, Guilhem Janbon, Ulrich Kück, Joseph Heitman

Notice bibliographique

RevueGenetics · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFungal Infections and Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institutes of HealthDeutsche ForschungsgemeinschaftCanadian Institute for Advanced Research
Mots-clésBiologyCryptococcus neoformansGeneticsMating typeLocus (genetics)GeneAllele

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract This study demonstrated that the ribosomal proteins Rpl22 and Rpl39 encoded by the MAT locus of Cryptococcus neoformans are essential. Focusing on the RPL22a and RPL22α alleles, Ianiri et al. found differential expression of the two RPL22... The MAT locus of Cryptococcus neoformans has a bipolar organization characterized by an unusually large structure, spanning over 100 kb. MAT genes have been characterized by functional genetics as being involved in sexual reproduction and virulence. However, classical gene replacement failed to achieve mutants for five MAT genes (RPL22, RPO41, MYO2, PRT1, and RPL39), indicating that they are likely essential. In the present study, targeted gene replacement was performed in a diploid strain for both the α and a alleles of the ribosomal genes RPL22 and RPL39. Mendelian analysis of the progeny confirmed that both RPL22 and RPL39 are essential for viability. Ectopic integration of the RPL22 allele of opposite MAT identity in the heterozygous RPL22a/rpl22αΔ or RPL22α/rpl22aΔ mutant strains failed to complement their essential phenotype. Evidence suggests that this is due to differential expression of the RPL22 genes, and an RNAi-dependent mechanism that contributes to control RPL22a expression. Furthermore, via CRISPR/Cas9 technology, the RPL22 alleles were exchanged in haploid MATα and MATa strains of C. neoformans. These RPL22 exchange strains displayed morphological and genetic defects during bilateral mating. These results contribute to elucidating functions of C. neoformans essential mating type genes that may constitute a type of imprinting system to promote inheritance of nuclei of both mating types.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,540
Score d'incertitude au seuil0,361

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueGeneticsMême sujetFungal Infections and StudiesTravaux en français237 207