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Enregistrement W2998286748 · doi:10.1101/2019.12.23.874487

<i>RAS</i> mutations drive proliferative chronic myelomonocytic leukemia via activation of a novel KMT2A-PLK1 axis

2019· preprint· en· W2998286748 sur OpenAlexaff
Ryan M. Carr, Denis Vorobyev, Terra L. Lasho, David L. Marks, Ezequiel J. Tolosa, Alexis Vedder, Luciana L. Almada, Andrey A. Yurchenko, Ismaël Padioleau, Bonnie Alver, Giacomo Coltro, Moritz Binder, Stephanie L. Safgren, Isaac P. Horn, Xiaona You, Nathalie Droin, Éric Solary, Maria E. Balasis, Kurt Berger, Christopher L. Pin, Thomas E. Witzig, Ajinkya Buradkar, Temeida Graf, Peter Valent, Abhishek A. Mangaonkar, Keith D. Robertson, Matthew T. Howard, Scott H. Kaufmann, Martín E. Fernández-Zapico, Klaus Geißler, Eric Padron, Jing Zhang, Sergey I. Nikolaev, Mrinal M. Patnaik

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Myeloid Leukemia Research
Établissements canadiensLawson Health Research InstituteWestern University
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesConquer Cancer FoundationInstitut Gustave-RoussyAustrian Science FundGeorgia Clinical and Translational Science AllianceLigue Contre le CancerAmerican Society of Clinical OncologyNational Institutes of HealthHenry J. Predolin Foundation for Research in LeukemiaUniversity of Wisconsin Carbone Cancer CenterNational Cancer InstituteInstitut National Du Cancer
Mots-clésChronic myelomonocytic leukemiaNeuroblastoma RAS viral oncogene homologCancer researchBiologyHRASMutationMyelodysplastic syndromesGeneKRASGeneticsImmunologyBone marrow

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Chronic myelomonocytic leukemia (CMML) is an aggressive hematological malignancy with limited treatment options. Whole exome (WES) and targeted sequencing of several independent cohorts of CMML patients, comparing dysplastic (dCMML) to proliferative (pCMML) CMML, as well as paired chronic phase disease and acute leukemic transformation (LT), associate acquisition of oncogenic RAS pathway mutations, the most common being NRAS G12D , with aggressive disease and with disease progression. Using patient derived progenitor colony assays and a NRAS G12D -Vav-Cre mouse model, we further demonstrate the role of mutant RAS signaling in driving and maintaining pCMML phenotype. RNA-sequencing links RAS pathway mutations with an increased expression of genes encoding the mitotic checkpoint kinases PLK1 and WEE1. Further, we dmeoinstrated that non-mutated lysine methyltransferase KMT2A (MLL1) acts as mediator of NRAS-induced PLK1 and WEE1 expression. Finally, we demonstrate the translational value of our findings by showing that pharmacological PLK1 inhibition decreases monocytosis and hepatosplenomegaly while improving hematopoiesis in RAS mutant patient-derived xenografts. Hence, we define severe CMML as oncogenic RAS pathway-enriched malignancies, with a unique gene expression profile regulated by KMT2A , amenable to therapeutic intervention.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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