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Enregistrement W2998461574

Biological cell trap arrays with applications to extraordinary optical transmission based immunobiosensing assays

2019· dissertation· en· W2998461574 sur OpenAlexfundno aff
Sean F. Romanuik

Notice bibliographique

RevueSummit (Simon Fraser University) · 2019
Typedissertation
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueMicrofluidic and Bio-sensing Technologies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesSimon Fraser University
Mots-clésTrap (plumbing)Transmission (telecommunications)NanotechnologyComputer sciencePhysicsMaterials scienceTelecommunications
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This thesis’ work is part of a multi-disciplinary project developing a novel immunobiosensing (IBS) platform to monitor antibody (Ab) production by specific cells trapped in a micromachined slide. This platform consists of two subsystems, the micromachined slide featuring the cell traps and the IBS slide integrated with the traps to gauge the affinity with which Ab(s) secreted by specific trapped cells bind an immobilized target antigen (Ag). This thesis’ primary contributions involve the design, fabrication, and experimental testing of multiple cell trap generations—including their integration with co-designed IBS slides. Hydrodynamic flows and sedimentation under gravity are used to trap cells, as they are gentler and require fewer components than other methods. Hydrodynamic flows that guide cells into cup-based traps in enclosed microfluidic channels are investigated. However, their enclosed nature complicates removing extraneous untrapped cells, selectively retrieving trapped cells, and device cleaning between experiments. An open system involving arrays of microwell-(MW)-based traps are used for all subsequent traps. Multiple generations of MW traps and co-designed IBS slides are presented, with each generation refined to further streamline alignment and examination via optical microscopy. Statistical analyses of the observed distribution of trapped cells in the MWs confirm that sedimentation is Poisson distributed, and further suggest that a zero-inflated Poisson (ZIP) function serves as a superior model. This thesis shows that cells can be trapped into an open array of MW traps subsequently aligned with an IBS slide to gauge the affinity with which cell-secreted Ab(s) bind a target Ag. Further refinement to the Extraordinary Optical Transmission (EOT)-based IBS slide used in this thesis is required to achieve Ab-Ag binding detection at the desired single cell/trap level and to improve the IBS slide re-usability. Integration of the traps with a different IBS subsystem is also a possibility. As potential future work, it is proposed that a micropipette needle be used to obtain a revised single cell/trap distribution prior to IBS slide integration and to retrieve the cells of interest selectively.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,298
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,196
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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