Composite genome sequence of Bacillus clausii, a probiotic commercially available as Enterogermina®, and insights into its probiotic properties
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Some of the spore-forming strains of Bacillus probiotics are marketed commercially as they survive harsh gastrointestinal conditions and bestow health benefits to the host. RESULTS: We report the composite genome of Bacillus clausii ENTPro from a commercially available probiotic Enterogermina® and compare it with the genomes of other Bacillus probiotics. We find that the members of B. clausii species harbor high heterogeneity at the species as well as genus level. The genes conferring resistance to chloramphenicol, streptomycin, rifampicin, and tetracycline in the B. clausii ENTPro strain could be identified. The genes coding for the bacteriocin gallidermin, which prevents biofilm formation in the pathogens Staphylococcus aureus and S. epidermidis, were also identified. KEGG Pathway analysis suggested that the folate biosynthesis pathway, which depicts one of the important roles of probiotics in the host, is conserved completely in B. subtilis and minimally in B. clausii and other probiotics. CONCLUSIONS: We identified various antibiotic resistance, bacteriocins, stress-related, and adhesion-related domains, and industrially-relevant pathways, in the genomes of these probiotic bacteria that are likely to help them survive in the harsh gastrointestinal tract, facilitating adhesion to host epithelial cells, persistence during antibiotic treatment and combating bacterial infections.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle