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Enregistrement W2998516355 · doi:10.1016/j.nicl.2019.102150

Novel data-driven, equation-free method captures spatio-temporal patterns of neurodegeneration in Parkinson's disease: Application of dynamic mode decomposition to PET

2019· article· en· W2998516355 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueNeuroImage Clinical · 2019
Typearticle
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueModel Reduction and Neural Networks
Établissements canadiensVancouver Coastal HealthUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of British ColumbiaCanada Research ChairsFondation Brain Canada
Mots-clésParkinson's diseaseNeurodegenerationNeurosciencePhysicsDiseaseMedicinePsychologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Most neurodegenerative disorders are characterized by progressive loss of neurons throughout the course of disease in the form of specific spatio-temporal patterns. To capture and quantify these coherent patterns across both space and time, traditionally one would either fit a pre-defined model with spatial and temporal parameters or apply analysis in the spatial and temporal domains separately. In this work, we introduce and validate the use of dynamic mode decomposition (DMD), a data-driven multivariate approach, to extract coupled spatio-temporal patterns simultaneously. We apply the method to examine progressive dopaminergic degeneration in 41 patients with Parkinson's disease (PD) using [11C](±)dihydrotetrabenazine (DTBZ) Positron Emission Tomography (PET). DMD decomposed the progressive dopaminergic changes in the putamen into two orthogonal temporal progression curves associated with distinct spatial patterns: 1) an anterior-posterior gradient, the expression of which decreased gradually with disease progression with a higher initial expression in the less affected side; 2) a dorsal-ventral gradient in the less affected side, which was present in early disease stage only. In the caudate, we found a head-tail gradient analogous to the anterior-posterior gradient seen in the putamen; as in the putamen, the expression of this gradient decreased gradually with disease progression with higher expression in the less affected side. Our results with DTBZ PET data show the applicability and relevance of the proposed method for extracting spatio-temporal patterns of neurotransmitter changes due to neurodegeneration. The method is able to decompose known PD-induced dopaminergic denervation into orthogonal (and thus loosely independent) temporal curves, which may be able to reflect and separate either different mechanisms underlying disease progression and disease initiation, or differential involvement of striatal sub-regions at different disease stages, in a completely data driven way. It is expected that this method can be easily extended to other PET tracers and neurodegenerative disorders and may help to elucidate disease mechanisms in more details compared to traditional approaches.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,482
Score d'incertitude au seuil0,626

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,398
Écart entre enseignants0,346 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle