Characterization of Src kinase kinetic and inhibition mechanisms
Notice bibliographique
Résumé
Src Kinase catalyzes phosphoryl transfer from ATP to tyrosine residues on proteins. In this study, we have investigated the steady state kinetics of the Src kinase reaction in a microfluidic chip‐based mobility shift assay using the Caliper LabChip 3000 instrument. Saturation kinetics is observed with both ATP and a gastrin‐derived peptide substrate. The bireactant kinetics observed suggest a sequential kinetic mechanism. Comparison of the rates of catalysis in the presence of H 2 O and D 2 O yields a significant solvent kinetic isotope effect on Vmax with a value of 3.3 ± 0.2, but no effect on V/K for either ATP or the peptide substrate. This observation suggests that the isotope sensitive step occurs after the first irreversible step, the release of the first product in the reaction cycle. To further support drug discovery efforts, the mechanism of small molecule inhibitors of Src kinase was determined. Steady state kinetic analysis of the data suggests that all of the compounds are competitive against ATP. The binding of these inhibitors to the ATP site is further supported by double inhibition (Yonetani‐Theorell) analysis, using a known competitive inhibitor of Src kinase.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».