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Enregistrement W2998704413 · doi:10.1111/biom.13210

Estimating treatment importance in multidrug‐resistant tuberculosis using Targeted Learning: An observational individual patient data network meta‐analysis

2019· article· en· W2998704413 sur OpenAlexafffund
Guanbo Wang, Mireille E. Schnitzer, Dick Menzies, Piret Viiklepp, Timothy H. Holtz, Andrea Benedetti

Notice bibliographique

RevueBiometrics · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensMcGill University Health CentreUniversité de MontréalMcGill University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésObservational studyEstimatorMedicineMetric (unit)TuberculosisIdentifiabilityContext (archaeology)StatisticsEconometricsMathematicsComputer scienceBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Persons with multidrug-resistant tuberculosis (MDR-TB) have a disease resulting from a strain of tuberculosis (TB) that does not respond to at least isoniazid and rifampicin, the two most effective anti-TB drugs. MDR-TB is always treated with multiple antimicrobial agents. Our data consist of individual patient data from 31 international observational studies with varying prescription practices, access to medications, and distributions of antibiotic resistance. In this study, we develop identifiability criteria for the estimation of a global treatment importance metric in the context where not all medications are observed in all studies. With stronger causal assumptions, this treatment importance metric can be interpreted as the effect of adding a medication to the existing treatments. We then use this metric to rank 15 observed antimicrobial agents in terms of their estimated add-on value. Using the concept of transportability, we propose an implementation of targeted maximum likelihood estimation, a doubly robust and locally efficient plug-in estimator, to estimate the treatment importance metric. A clustered sandwich estimator is adopted to compute variance estimates and produce confidence intervals. Simulation studies are conducted to assess the performance of our estimator, verify the double robustness property, and assess the appropriateness of the variance estimation approach.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,071
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,116
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: Méta-analyse
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,071
Score d'incertitude au seuil0,374

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0710,116
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0050,016
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,367
Tête enseignante GPT0,423
Écart entre enseignants0,056 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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