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Enregistrement W2998806173 · doi:10.1097/pas.0000000000001439

Head and Neck Mesenchymal Neoplasms With GLI1 Gene Alterations

2020· article· en· W2998806173 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueThe American Journal of Surgical Pathology · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHedgehog Signaling Pathway Studies
Établissements canadiensMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésGLI1PathologyTongueBiologyMalignancyFluorescence in situ hybridizationMedicineChromosomeGeneHedgehog signaling pathwayGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Soft tissue tumors with GLI1 gene fusions or amplifications have been recently described as a unique pathologic entity with an established risk of malignancy. We herein expand these findings by investigating a cohort of 11 head and neck lesions with GLI1 alterations, including 8 from the tongue, for their clinicopathologic and molecular features. The tumors commonly affected males in their 30s (male:female ratio 2.7:1; range: 1 to 65). Tumors showed a multinodular growth pattern, nested architecture separated by a delicate, arborizing vascular network, monotonous round to ovoid nuclei, and clear cytoplasm. Tumor protrusion into vascular spaces was common. Genetic alterations were investigated by fluorescence in situ hybridization and/or targeted RNA sequencing. Seven tumors harbored GLI1 fusions with the following partners: ACTB (n=4), PTCH1 (n=2), or MALAT1 (n=1). The remaining 4 cases showed coamplifications of GLI1 with CDK4 and MDM2 genes. Tumors were commonly positive for S100 protein and CD56. CDK4, MDM2, and STAT6 were positive in GLI1-amplified tumors. Two of 6 patients with available follow-up (1 each with GLI1 amplification and PTCH1-GLI1 fusion) developed distant metastases. Both tumors showed a high mitotic index and tumor necrosis. The head and neck region, particularly tongue, is a common location for GLI1-related mesenchymal tumors. Although a morphologic overlap was noted with the previously reported "pericytoma with t(7,12) translocation," often occurring in the tongue, our findings expand the original findings, to include a more variable immunophenotype, propensity for late distant metastases, and alternative mechanisms of GLI1 oncogenic activation, such as various GLI1 fusion partners or GLI1 coamplifications with MDM2 and CDK4 genes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,585
Score d'incertitude au seuil0,290

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle