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Enregistrement W2998829429 · doi:10.22203/ecm.v039a03

YAP/TAZ regulates the expression of proteoglycan 4 and tenascin C in superficial-zone chondrocytes

2020· article· en· W2998829429 sur OpenAlexafffund
E. Delve, Vivian Co, S. Regmi, Justin Parreno, TA Schmidt, RA Kandel

Notice bibliographique

RevueEuropean Cells and Materials · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHippo pathway signaling and YAP/TAZ
Établissements canadiensUniversity of CalgaryLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteUniversity of TorontoUniversity of Ontario Institute of TechnologyMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésGene knockdownCTGFCell biologyHippo signaling pathwayCytochalasin DRHOABiologyTranscription factorChemistryMolecular biologySignal transductionGrowth factorCytoskeletonCellBiochemistryReceptorGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The roles of cell division control protein 42 homologue (CDC42) and actin polymerisation in regulating the phenotype of superficial-zone chondrocytes (SZCs) have been demonstrated in vitro; however, the signalling pathway(s) downstream have yet to be fully elucidated. The study hypothesis was that Yes-associated protein (YAP) and transcriptional co-activator with PDZ-binding motif (TAZ) act downstream to regulate proteoglycan 4 (PRG4) and tenascin C (TNC). Bovine SZCs grown in monolayer were treated with ML141 (CDC42 inhibitor) or the actin depolymerising agents, latrunculin B and cytochalasin D, to determine the effect on YAP/TAZ. Verteporfin (YAP/TAZ inhibitor) and YAP/TAZ siRNA-mediated knockdown were used to determine their role in regulating PRG4 and TNC. ML141 treatment reduced total YAP/TAZ protein, nuclear TAZ levels and the YAP/TAZ target gene, connective tissue growth factor (CTGF) mRNA levels. Latrunculin B decreased nuclear TAZ, while cytochalasin D treatment trended towards increased nuclear TAZ (p = 0.06), correlating with decreased and increased CTGF mRNA levels, respectively. Verteporfin treatment decreased PRG4 and TNC expression, with no effect on actin polymerisation. siRNA-mediated knockdown of YAP/TAZ revealed that PRG4 was regulated by YAP/TAZ while TNC was regulated by TAZ only. As cytochalasin D can activate myocardin-related transcription factor-A (MRTF-A), siRNA-mediated knockdown was performed to determine the role of MRTF-A in regulating YAP/TAZ. Although nuclear TAZ decreased, no significant changes in total protein levels were observed. Findings suggested that CDC42 and actin polymerisation regulated SZCs through multiple actin-regulated pathways. Understanding the regulation of these chondroprotective molecules may have important implications for prevention/treatment of osteoarthritis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,193
Écart entre enseignants0,183 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2020
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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